Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRNP1Q6NT89 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TRNP1Q6NT89 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRNP1Q6NT89 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRNP1Q6NT89 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRNP1Q6NT89 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRNP1Q6NT89 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRNP1Q6NT89 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRNP1Q6NT89 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRNP1Q6NT89 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRNP1Q6NT89 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRNP1Q6NT89 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRNP1Q6NT89 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRNP1Q6NT89 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRNP1Q6NT89 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRNP1Q6NT89 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRNP1Q6NT89 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRNP1Q6NT89 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRNP1Q6NT89 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRNP1Q6NT89 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRNP1Q6NT89 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRNP1Q6NT89 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRNP1Q6NT89 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRNP1Q6NT89 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRNP1Q6NT89 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRNP1Q6NT89 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRNP1Q6NT89 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRNP1Q6NT89 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRNP1Q6NT89 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRNP1Q6NT89 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRNP1Q6NT89 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRNP1Q6NT89 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRNP1Q6NT89 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRNP1Q6NT89 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TRNP1Q6NT89 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRNP1Q6NT89 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRNP1Q6NT89 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRNP1Q6NT89 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TRNP1Q6NT89 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRNP1Q6NT89 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRNP1Q6NT89 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TRNP1Q6NT89 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TRNP1Q6NT89 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TRNP1Q6NT89 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TRNP1Q6NT89 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TRNP1Q6NT89 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRNP1Q6NT89 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRNP1Q6NT89 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRNP1Q6NT89 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRNP1Q6NT89 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRNP1Q6NT89 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRNP1Q6NT89 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRNP1Q6NT89 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRNP1Q6NT89 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRNP1Q6NT89 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRNP1Q6NT89 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TRNP1Q6NT89 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRNP1Q6NT89 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRNP1Q6NT89 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRNP1Q6NT89 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRNP1Q6NT89 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRNP1Q6NT89 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TRNP1Q6NT89 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRNP1Q6NT89 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRNP1Q6NT89 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRNP1Q6NT89 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRNP1Q6NT89 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRNP1Q6NT89 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRNP1Q6NT89 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRNP1Q6NT89 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRNP1Q6NT89 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRNP1Q6NT89 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TRNP1Q6NT89 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRNP1Q6NT89 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRNP1Q6NT89 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRNP1Q6NT89 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRNP1Q6NT89 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRNP1Q6NT89 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRNP1Q6NT89 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRNP1Q6NT89 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRNP1Q6NT89 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRNP1Q6NT89 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRNP1Q6NT89 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRNP1Q6NT89 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRNP1Q6NT89 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRNP1Q6NT89 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRNP1Q6NT89 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRNP1Q6NT89 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRNP1Q6NT89 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRNP1Q6NT89 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRNP1Q6NT89 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRNP1Q6NT89 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRNP1Q6NT89 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRNP1Q6NT89 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRNP1Q6NT89 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRNP1Q6NT89 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRNP1Q6NT89 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRNP1Q6NT89 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRNP1Q6NT89 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRNP1Q6NT89 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms