Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSQ5

Sp140, Sp140 nuclear body protein, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp140Q6NSQ5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sp140Q6NSQ5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sp140Q6NSQ5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sp140Q6NSQ5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sp140Q6NSQ5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sp140Q6NSQ5 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sp140Q6NSQ5 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Sp140Q6NSQ5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sp140Q6NSQ5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sp140Q6NSQ5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sp140Q6NSQ5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sp140Q6NSQ5 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sp140Q6NSQ5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sp140Q6NSQ5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sp140Q6NSQ5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sp140Q6NSQ5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sp140Q6NSQ5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sp140Q6NSQ5 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sp140Q6NSQ5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sp140Q6NSQ5 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sp140Q6NSQ5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sp140Q6NSQ5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sp140Q6NSQ5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sp140Q6NSQ5 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sp140Q6NSQ5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sp140Q6NSQ5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sp140Q6NSQ5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sp140Q6NSQ5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Sp140Q6NSQ5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Sp140Q6NSQ5 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sp140Q6NSQ5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sp140Q6NSQ5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sp140Q6NSQ5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sp140Q6NSQ5 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sp140Q6NSQ5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sp140Q6NSQ5 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Sp140Q6NSQ5 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sp140Q6NSQ5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sp140Q6NSQ5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sp140Q6NSQ5 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sp140Q6NSQ5 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sp140Q6NSQ5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sp140Q6NSQ5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sp140Q6NSQ5 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sp140Q6NSQ5 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sp140Q6NSQ5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sp140Q6NSQ5 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sp140Q6NSQ5 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sp140Q6NSQ5 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sp140Q6NSQ5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sp140Q6NSQ5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sp140Q6NSQ5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sp140Q6NSQ5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sp140Q6NSQ5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sp140Q6NSQ5 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sp140Q6NSQ5 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sp140Q6NSQ5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sp140Q6NSQ5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sp140Q6NSQ5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sp140Q6NSQ5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sp140Q6NSQ5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sp140Q6NSQ5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sp140Q6NSQ5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sp140Q6NSQ5 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sp140Q6NSQ5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sp140Q6NSQ5 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sp140Q6NSQ5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sp140Q6NSQ5 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sp140Q6NSQ5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sp140Q6NSQ5 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sp140Q6NSQ5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sp140Q6NSQ5 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sp140Q6NSQ5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sp140Q6NSQ5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sp140Q6NSQ5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sp140Q6NSQ5 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sp140Q6NSQ5 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sp140Q6NSQ5 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sp140Q6NSQ5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sp140Q6NSQ5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sp140Q6NSQ5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sp140Q6NSQ5 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sp140Q6NSQ5 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sp140Q6NSQ5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sp140Q6NSQ5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sp140Q6NSQ5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sp140Q6NSQ5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sp140Q6NSQ5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sp140Q6NSQ5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sp140Q6NSQ5 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sp140Q6NSQ5 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sp140Q6NSQ5 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sp140Q6NSQ5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Sp140Q6NSQ5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sp140Q6NSQ5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sp140Q6NSQ5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Sp140Q6NSQ5 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sp140Q6NSQ5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Sp140Q6NSQ5 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Sp140Q6NSQ5 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms