Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
CARMIL2Q6F5E8 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC36.33■■■■□ 3.41
CARMIL2Q6F5E8 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
CARMIL2Q6F5E8 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
CARMIL2Q6F5E8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
CARMIL2Q6F5E8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
CARMIL2Q6F5E8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
CARMIL2Q6F5E8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
CARMIL2Q6F5E8 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
CARMIL2Q6F5E8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
CARMIL2Q6F5E8 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
CARMIL2Q6F5E8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
CARMIL2Q6F5E8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
CARMIL2Q6F5E8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
CARMIL2Q6F5E8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
CARMIL2Q6F5E8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
CARMIL2Q6F5E8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
CARMIL2Q6F5E8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
CARMIL2Q6F5E8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
CARMIL2Q6F5E8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
CARMIL2Q6F5E8 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
CARMIL2Q6F5E8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
CARMIL2Q6F5E8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
CARMIL2Q6F5E8 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
CARMIL2Q6F5E8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
CARMIL2Q6F5E8 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC36.29■■■■□ 3.4
CARMIL2Q6F5E8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
CARMIL2Q6F5E8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
CARMIL2Q6F5E8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
CARMIL2Q6F5E8 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
CARMIL2Q6F5E8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
CARMIL2Q6F5E8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
CARMIL2Q6F5E8 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
CARMIL2Q6F5E8 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
CARMIL2Q6F5E8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
CARMIL2Q6F5E8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
CARMIL2Q6F5E8 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
CARMIL2Q6F5E8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
CARMIL2Q6F5E8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
CARMIL2Q6F5E8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
CARMIL2Q6F5E8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
CARMIL2Q6F5E8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
CARMIL2Q6F5E8 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
CARMIL2Q6F5E8 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
CARMIL2Q6F5E8 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
CARMIL2Q6F5E8 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
CARMIL2Q6F5E8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
CARMIL2Q6F5E8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.39
CARMIL2Q6F5E8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
CARMIL2Q6F5E8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.39
CARMIL2Q6F5E8 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
CARMIL2Q6F5E8 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
CARMIL2Q6F5E8 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
CARMIL2Q6F5E8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
CARMIL2Q6F5E8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
CARMIL2Q6F5E8 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
CARMIL2Q6F5E8 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC36.25■■■■□ 3.39
CARMIL2Q6F5E8 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
CARMIL2Q6F5E8 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
CARMIL2Q6F5E8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
CARMIL2Q6F5E8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
CARMIL2Q6F5E8 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
CARMIL2Q6F5E8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
CARMIL2Q6F5E8 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC36.24■■■■□ 3.39
CARMIL2Q6F5E8 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
CARMIL2Q6F5E8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
CARMIL2Q6F5E8 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
CARMIL2Q6F5E8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC36.23■■■■□ 3.39
CARMIL2Q6F5E8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
CARMIL2Q6F5E8 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
CARMIL2Q6F5E8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC36.23■■■■□ 3.39
CARMIL2Q6F5E8 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
CARMIL2Q6F5E8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
CARMIL2Q6F5E8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
CARMIL2Q6F5E8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
CARMIL2Q6F5E8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
CARMIL2Q6F5E8 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC36.22■■■■□ 3.39
CARMIL2Q6F5E8 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
CARMIL2Q6F5E8 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
CARMIL2Q6F5E8 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
CARMIL2Q6F5E8 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
CARMIL2Q6F5E8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
CARMIL2Q6F5E8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
CARMIL2Q6F5E8 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
CARMIL2Q6F5E8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
CARMIL2Q6F5E8 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
CARMIL2Q6F5E8 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
CARMIL2Q6F5E8 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
CARMIL2Q6F5E8 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
CARMIL2Q6F5E8 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
CARMIL2Q6F5E8 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
CARMIL2Q6F5E8 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
CARMIL2Q6F5E8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
CARMIL2Q6F5E8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
CARMIL2Q6F5E8 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
CARMIL2Q6F5E8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
CARMIL2Q6F5E8 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
CARMIL2Q6F5E8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
CARMIL2Q6F5E8 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
CARMIL2Q6F5E8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms