Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ9

EFCAB2, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB2Q5VUJ9 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
EFCAB2Q5VUJ9 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
EFCAB2Q5VUJ9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
EFCAB2Q5VUJ9 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
EFCAB2Q5VUJ9 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC34.71■■■■□ 3.15
EFCAB2Q5VUJ9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
EFCAB2Q5VUJ9 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC34.7■■■■□ 3.15
EFCAB2Q5VUJ9 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC34.7■■■■□ 3.15
EFCAB2Q5VUJ9 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
EFCAB2Q5VUJ9 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
EFCAB2Q5VUJ9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
EFCAB2Q5VUJ9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
EFCAB2Q5VUJ9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
EFCAB2Q5VUJ9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
EFCAB2Q5VUJ9 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC34.69■■■■□ 3.14
EFCAB2Q5VUJ9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
EFCAB2Q5VUJ9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
EFCAB2Q5VUJ9 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
EFCAB2Q5VUJ9 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC34.68■■■■□ 3.14
EFCAB2Q5VUJ9 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
EFCAB2Q5VUJ9 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
EFCAB2Q5VUJ9 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
EFCAB2Q5VUJ9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
EFCAB2Q5VUJ9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
EFCAB2Q5VUJ9 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
EFCAB2Q5VUJ9 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.14
EFCAB2Q5VUJ9 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
EFCAB2Q5VUJ9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
EFCAB2Q5VUJ9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
EFCAB2Q5VUJ9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
EFCAB2Q5VUJ9 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
EFCAB2Q5VUJ9 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
EFCAB2Q5VUJ9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
EFCAB2Q5VUJ9 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
EFCAB2Q5VUJ9 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
EFCAB2Q5VUJ9 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
EFCAB2Q5VUJ9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
EFCAB2Q5VUJ9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
EFCAB2Q5VUJ9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
EFCAB2Q5VUJ9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
EFCAB2Q5VUJ9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
EFCAB2Q5VUJ9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
EFCAB2Q5VUJ9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
EFCAB2Q5VUJ9 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
EFCAB2Q5VUJ9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
EFCAB2Q5VUJ9 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
EFCAB2Q5VUJ9 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
EFCAB2Q5VUJ9 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
EFCAB2Q5VUJ9 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
EFCAB2Q5VUJ9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
EFCAB2Q5VUJ9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
EFCAB2Q5VUJ9 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
EFCAB2Q5VUJ9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
EFCAB2Q5VUJ9 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
EFCAB2Q5VUJ9 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
EFCAB2Q5VUJ9 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
EFCAB2Q5VUJ9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
EFCAB2Q5VUJ9 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
EFCAB2Q5VUJ9 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
EFCAB2Q5VUJ9 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
EFCAB2Q5VUJ9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
EFCAB2Q5VUJ9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
EFCAB2Q5VUJ9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
EFCAB2Q5VUJ9 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
EFCAB2Q5VUJ9 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
EFCAB2Q5VUJ9 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
EFCAB2Q5VUJ9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
EFCAB2Q5VUJ9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
EFCAB2Q5VUJ9 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC34.6■■■■□ 3.13
EFCAB2Q5VUJ9 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
EFCAB2Q5VUJ9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC34.6■■■■□ 3.13
EFCAB2Q5VUJ9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
EFCAB2Q5VUJ9 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
EFCAB2Q5VUJ9 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
EFCAB2Q5VUJ9 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
EFCAB2Q5VUJ9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
EFCAB2Q5VUJ9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
EFCAB2Q5VUJ9 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
EFCAB2Q5VUJ9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
EFCAB2Q5VUJ9 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
EFCAB2Q5VUJ9 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
EFCAB2Q5VUJ9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
EFCAB2Q5VUJ9 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
EFCAB2Q5VUJ9 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
EFCAB2Q5VUJ9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
EFCAB2Q5VUJ9 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
EFCAB2Q5VUJ9 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
EFCAB2Q5VUJ9 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC34.56■■■■□ 3.12
EFCAB2Q5VUJ9 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
EFCAB2Q5VUJ9 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
EFCAB2Q5VUJ9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
EFCAB2Q5VUJ9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
EFCAB2Q5VUJ9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
EFCAB2Q5VUJ9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
EFCAB2Q5VUJ9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
EFCAB2Q5VUJ9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
EFCAB2Q5VUJ9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
EFCAB2Q5VUJ9 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
EFCAB2Q5VUJ9 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
EFCAB2Q5VUJ9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms