Protein–RNA interactions for Protein: Q5VU97

CACHD1, VWFA and cache domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,274 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACHD1Q5VU97 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACHD1Q5VU97 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACHD1Q5VU97 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACHD1Q5VU97 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CACHD1Q5VU97 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACHD1Q5VU97 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACHD1Q5VU97 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACHD1Q5VU97 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACHD1Q5VU97 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACHD1Q5VU97 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACHD1Q5VU97 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACHD1Q5VU97 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACHD1Q5VU97 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACHD1Q5VU97 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACHD1Q5VU97 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACHD1Q5VU97 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACHD1Q5VU97 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACHD1Q5VU97 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACHD1Q5VU97 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACHD1Q5VU97 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACHD1Q5VU97 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CACHD1Q5VU97 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACHD1Q5VU97 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACHD1Q5VU97 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACHD1Q5VU97 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACHD1Q5VU97 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACHD1Q5VU97 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CACHD1Q5VU97 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACHD1Q5VU97 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACHD1Q5VU97 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACHD1Q5VU97 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACHD1Q5VU97 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACHD1Q5VU97 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACHD1Q5VU97 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACHD1Q5VU97 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACHD1Q5VU97 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACHD1Q5VU97 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACHD1Q5VU97 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACHD1Q5VU97 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACHD1Q5VU97 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACHD1Q5VU97 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACHD1Q5VU97 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACHD1Q5VU97 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACHD1Q5VU97 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CACHD1Q5VU97 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACHD1Q5VU97 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACHD1Q5VU97 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACHD1Q5VU97 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACHD1Q5VU97 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACHD1Q5VU97 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACHD1Q5VU97 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CACHD1Q5VU97 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACHD1Q5VU97 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACHD1Q5VU97 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CACHD1Q5VU97 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CACHD1Q5VU97 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CACHD1Q5VU97 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CACHD1Q5VU97 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACHD1Q5VU97 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACHD1Q5VU97 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACHD1Q5VU97 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACHD1Q5VU97 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACHD1Q5VU97 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACHD1Q5VU97 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACHD1Q5VU97 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACHD1Q5VU97 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACHD1Q5VU97 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACHD1Q5VU97 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACHD1Q5VU97 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACHD1Q5VU97 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACHD1Q5VU97 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACHD1Q5VU97 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACHD1Q5VU97 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACHD1Q5VU97 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACHD1Q5VU97 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACHD1Q5VU97 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACHD1Q5VU97 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACHD1Q5VU97 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CACHD1Q5VU97 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CACHD1Q5VU97 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACHD1Q5VU97 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACHD1Q5VU97 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACHD1Q5VU97 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACHD1Q5VU97 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACHD1Q5VU97 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACHD1Q5VU97 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACHD1Q5VU97 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACHD1Q5VU97 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACHD1Q5VU97 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACHD1Q5VU97 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACHD1Q5VU97 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACHD1Q5VU97 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CACHD1Q5VU97 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACHD1Q5VU97 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACHD1Q5VU97 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACHD1Q5VU97 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACHD1Q5VU97 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACHD1Q5VU97 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACHD1Q5VU97 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACHD1Q5VU97 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
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