Protein–RNA interactions for Protein: Q5T215

TRAPPC3L, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3LQ5T215 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
TRAPPC3LQ5T215 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRAPPC3LQ5T215 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRAPPC3LQ5T215 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRAPPC3LQ5T215 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRAPPC3LQ5T215 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRAPPC3LQ5T215 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRAPPC3LQ5T215 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRAPPC3LQ5T215 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRAPPC3LQ5T215 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRAPPC3LQ5T215 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRAPPC3LQ5T215 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
TRAPPC3LQ5T215 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRAPPC3LQ5T215 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRAPPC3LQ5T215 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRAPPC3LQ5T215 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRAPPC3LQ5T215 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRAPPC3LQ5T215 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRAPPC3LQ5T215 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRAPPC3LQ5T215 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRAPPC3LQ5T215 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRAPPC3LQ5T215 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRAPPC3LQ5T215 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRAPPC3LQ5T215 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRAPPC3LQ5T215 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRAPPC3LQ5T215 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRAPPC3LQ5T215 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRAPPC3LQ5T215 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRAPPC3LQ5T215 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRAPPC3LQ5T215 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRAPPC3LQ5T215 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRAPPC3LQ5T215 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRAPPC3LQ5T215 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRAPPC3LQ5T215 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRAPPC3LQ5T215 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRAPPC3LQ5T215 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRAPPC3LQ5T215 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRAPPC3LQ5T215 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRAPPC3LQ5T215 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRAPPC3LQ5T215 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRAPPC3LQ5T215 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRAPPC3LQ5T215 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRAPPC3LQ5T215 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRAPPC3LQ5T215 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
TRAPPC3LQ5T215 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRAPPC3LQ5T215 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRAPPC3LQ5T215 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRAPPC3LQ5T215 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRAPPC3LQ5T215 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRAPPC3LQ5T215 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRAPPC3LQ5T215 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRAPPC3LQ5T215 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
TRAPPC3LQ5T215 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
TRAPPC3LQ5T215 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRAPPC3LQ5T215 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRAPPC3LQ5T215 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRAPPC3LQ5T215 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
TRAPPC3LQ5T215 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRAPPC3LQ5T215 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRAPPC3LQ5T215 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRAPPC3LQ5T215 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRAPPC3LQ5T215 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRAPPC3LQ5T215 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRAPPC3LQ5T215 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRAPPC3LQ5T215 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRAPPC3LQ5T215 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRAPPC3LQ5T215 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
TRAPPC3LQ5T215 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRAPPC3LQ5T215 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRAPPC3LQ5T215 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRAPPC3LQ5T215 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRAPPC3LQ5T215 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRAPPC3LQ5T215 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRAPPC3LQ5T215 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRAPPC3LQ5T215 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRAPPC3LQ5T215 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRAPPC3LQ5T215 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRAPPC3LQ5T215 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRAPPC3LQ5T215 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRAPPC3LQ5T215 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRAPPC3LQ5T215 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRAPPC3LQ5T215 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRAPPC3LQ5T215 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRAPPC3LQ5T215 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
TRAPPC3LQ5T215 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRAPPC3LQ5T215 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRAPPC3LQ5T215 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRAPPC3LQ5T215 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRAPPC3LQ5T215 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRAPPC3LQ5T215 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRAPPC3LQ5T215 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRAPPC3LQ5T215 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRAPPC3LQ5T215 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TRAPPC3LQ5T215 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
TRAPPC3LQ5T215 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
TRAPPC3LQ5T215 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TRAPPC3LQ5T215 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRAPPC3LQ5T215 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRAPPC3LQ5T215 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
TRAPPC3LQ5T215 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms