Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYE7

NHSL1, NHS-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1Q5SYE7 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
NHSL1Q5SYE7 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
NHSL1Q5SYE7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
NHSL1Q5SYE7 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
NHSL1Q5SYE7 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
NHSL1Q5SYE7 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
NHSL1Q5SYE7 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
NHSL1Q5SYE7 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
NHSL1Q5SYE7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
NHSL1Q5SYE7 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
NHSL1Q5SYE7 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
NHSL1Q5SYE7 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
NHSL1Q5SYE7 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
NHSL1Q5SYE7 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
NHSL1Q5SYE7 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
NHSL1Q5SYE7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
NHSL1Q5SYE7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
NHSL1Q5SYE7 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
NHSL1Q5SYE7 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
NHSL1Q5SYE7 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
NHSL1Q5SYE7 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
NHSL1Q5SYE7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
NHSL1Q5SYE7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
NHSL1Q5SYE7 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
NHSL1Q5SYE7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
NHSL1Q5SYE7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
NHSL1Q5SYE7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
NHSL1Q5SYE7 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
NHSL1Q5SYE7 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
NHSL1Q5SYE7 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
NHSL1Q5SYE7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
NHSL1Q5SYE7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
NHSL1Q5SYE7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
NHSL1Q5SYE7 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
NHSL1Q5SYE7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
NHSL1Q5SYE7 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
NHSL1Q5SYE7 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
NHSL1Q5SYE7 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
NHSL1Q5SYE7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
NHSL1Q5SYE7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
NHSL1Q5SYE7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
NHSL1Q5SYE7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
NHSL1Q5SYE7 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
NHSL1Q5SYE7 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
NHSL1Q5SYE7 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
NHSL1Q5SYE7 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
NHSL1Q5SYE7 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
NHSL1Q5SYE7 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
NHSL1Q5SYE7 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
NHSL1Q5SYE7 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
NHSL1Q5SYE7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
NHSL1Q5SYE7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
NHSL1Q5SYE7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
NHSL1Q5SYE7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
NHSL1Q5SYE7 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
NHSL1Q5SYE7 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
NHSL1Q5SYE7 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
NHSL1Q5SYE7 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
NHSL1Q5SYE7 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
NHSL1Q5SYE7 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
NHSL1Q5SYE7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
NHSL1Q5SYE7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.57
NHSL1Q5SYE7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
NHSL1Q5SYE7 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
NHSL1Q5SYE7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
NHSL1Q5SYE7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
NHSL1Q5SYE7 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
NHSL1Q5SYE7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
NHSL1Q5SYE7 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
NHSL1Q5SYE7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
NHSL1Q5SYE7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
NHSL1Q5SYE7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
NHSL1Q5SYE7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
NHSL1Q5SYE7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
NHSL1Q5SYE7 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
NHSL1Q5SYE7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
NHSL1Q5SYE7 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC31.12■■■□□ 2.57
NHSL1Q5SYE7 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
NHSL1Q5SYE7 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
NHSL1Q5SYE7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
NHSL1Q5SYE7 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
NHSL1Q5SYE7 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
NHSL1Q5SYE7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
NHSL1Q5SYE7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
NHSL1Q5SYE7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
NHSL1Q5SYE7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
NHSL1Q5SYE7 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
NHSL1Q5SYE7 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
NHSL1Q5SYE7 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
NHSL1Q5SYE7 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
NHSL1Q5SYE7 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
NHSL1Q5SYE7 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC31.1■■■□□ 2.57
NHSL1Q5SYE7 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
NHSL1Q5SYE7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
NHSL1Q5SYE7 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
NHSL1Q5SYE7 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
NHSL1Q5SYE7 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
NHSL1Q5SYE7 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
NHSL1Q5SYE7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
NHSL1Q5SYE7 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms