Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NDUFA9Q16795 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NDUFA9Q16795 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NDUFA9Q16795 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NDUFA9Q16795 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NDUFA9Q16795 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NDUFA9Q16795 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDUFA9Q16795 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDUFA9Q16795 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDUFA9Q16795 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDUFA9Q16795 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDUFA9Q16795 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDUFA9Q16795 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NDUFA9Q16795 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDUFA9Q16795 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDUFA9Q16795 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDUFA9Q16795 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDUFA9Q16795 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDUFA9Q16795 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDUFA9Q16795 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDUFA9Q16795 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDUFA9Q16795 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDUFA9Q16795 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDUFA9Q16795 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDUFA9Q16795 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDUFA9Q16795 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDUFA9Q16795 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDUFA9Q16795 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDUFA9Q16795 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDUFA9Q16795 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDUFA9Q16795 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDUFA9Q16795 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDUFA9Q16795 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NDUFA9Q16795 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NDUFA9Q16795 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NDUFA9Q16795 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NDUFA9Q16795 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NDUFA9Q16795 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NDUFA9Q16795 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NDUFA9Q16795 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NDUFA9Q16795 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NDUFA9Q16795 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NDUFA9Q16795 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NDUFA9Q16795 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NDUFA9Q16795 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NDUFA9Q16795 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NDUFA9Q16795 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NDUFA9Q16795 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NDUFA9Q16795 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NDUFA9Q16795 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NDUFA9Q16795 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NDUFA9Q16795 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NDUFA9Q16795 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NDUFA9Q16795 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NDUFA9Q16795 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NDUFA9Q16795 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NDUFA9Q16795 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NDUFA9Q16795 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NDUFA9Q16795 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NDUFA9Q16795 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NDUFA9Q16795 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NDUFA9Q16795 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NDUFA9Q16795 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NDUFA9Q16795 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NDUFA9Q16795 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NDUFA9Q16795 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NDUFA9Q16795 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NDUFA9Q16795 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NDUFA9Q16795 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NDUFA9Q16795 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NDUFA9Q16795 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NDUFA9Q16795 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NDUFA9Q16795 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NDUFA9Q16795 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NDUFA9Q16795 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NDUFA9Q16795 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NDUFA9Q16795 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NDUFA9Q16795 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NDUFA9Q16795 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NDUFA9Q16795 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NDUFA9Q16795 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NDUFA9Q16795 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NDUFA9Q16795 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NDUFA9Q16795 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NDUFA9Q16795 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NDUFA9Q16795 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NDUFA9Q16795 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NDUFA9Q16795 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NDUFA9Q16795 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NDUFA9Q16795 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NDUFA9Q16795 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NDUFA9Q16795 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NDUFA9Q16795 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NDUFA9Q16795 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NDUFA9Q16795 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NDUFA9Q16795 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NDUFA9Q16795 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NDUFA9Q16795 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NDUFA9Q16795 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NDUFA9Q16795 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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