Protein–RNA interactions for Protein: Q15025

TNIP1, TNFAIP3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP1Q15025 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TNIP1Q15025 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TNIP1Q15025 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TNIP1Q15025 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TNIP1Q15025 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TNIP1Q15025 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
TNIP1Q15025 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
TNIP1Q15025 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TNIP1Q15025 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TNIP1Q15025 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
TNIP1Q15025 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TNIP1Q15025 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
TNIP1Q15025 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TNIP1Q15025 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TNIP1Q15025 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TNIP1Q15025 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TNIP1Q15025 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TNIP1Q15025 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
TNIP1Q15025 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
TNIP1Q15025 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TNIP1Q15025 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TNIP1Q15025 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TNIP1Q15025 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TNIP1Q15025 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TNIP1Q15025 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TNIP1Q15025 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TNIP1Q15025 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TNIP1Q15025 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TNIP1Q15025 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TNIP1Q15025 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TNIP1Q15025 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TNIP1Q15025 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TNIP1Q15025 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNIP1Q15025 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNIP1Q15025 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
TNIP1Q15025 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNIP1Q15025 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNIP1Q15025 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNIP1Q15025 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TNIP1Q15025 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TNIP1Q15025 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TNIP1Q15025 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TNIP1Q15025 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TNIP1Q15025 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
TNIP1Q15025 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TNIP1Q15025 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TNIP1Q15025 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TNIP1Q15025 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNIP1Q15025 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNIP1Q15025 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNIP1Q15025 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNIP1Q15025 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNIP1Q15025 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNIP1Q15025 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNIP1Q15025 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNIP1Q15025 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNIP1Q15025 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNIP1Q15025 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNIP1Q15025 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNIP1Q15025 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TNIP1Q15025 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TNIP1Q15025 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TNIP1Q15025 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TNIP1Q15025 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TNIP1Q15025 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TNIP1Q15025 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TNIP1Q15025 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TNIP1Q15025 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TNIP1Q15025 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TNIP1Q15025 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TNIP1Q15025 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TNIP1Q15025 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TNIP1Q15025 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
TNIP1Q15025 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TNIP1Q15025 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TNIP1Q15025 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TNIP1Q15025 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TNIP1Q15025 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TNIP1Q15025 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TNIP1Q15025 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TNIP1Q15025 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TNIP1Q15025 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TNIP1Q15025 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TNIP1Q15025 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
TNIP1Q15025 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TNIP1Q15025 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TNIP1Q15025 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNIP1Q15025 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNIP1Q15025 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNIP1Q15025 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNIP1Q15025 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNIP1Q15025 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNIP1Q15025 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNIP1Q15025 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNIP1Q15025 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TNIP1Q15025 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TNIP1Q15025 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TNIP1Q15025 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
TNIP1Q15025 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TNIP1Q15025 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms