Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
GAPVD1Q14C86 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
GAPVD1Q14C86 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
GAPVD1Q14C86 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
GAPVD1Q14C86 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
GAPVD1Q14C86 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
GAPVD1Q14C86 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
GAPVD1Q14C86 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
GAPVD1Q14C86 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
GAPVD1Q14C86 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
GAPVD1Q14C86 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
GAPVD1Q14C86 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
GAPVD1Q14C86 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
GAPVD1Q14C86 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
GAPVD1Q14C86 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
GAPVD1Q14C86 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
GAPVD1Q14C86 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
GAPVD1Q14C86 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
GAPVD1Q14C86 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC37.71■■■■□ 3.63
GAPVD1Q14C86 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
GAPVD1Q14C86 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
GAPVD1Q14C86 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
GAPVD1Q14C86 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
GAPVD1Q14C86 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
GAPVD1Q14C86 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
GAPVD1Q14C86 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
GAPVD1Q14C86 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
GAPVD1Q14C86 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
GAPVD1Q14C86 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.62
GAPVD1Q14C86 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.62
GAPVD1Q14C86 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC37.69■■■■□ 3.62
GAPVD1Q14C86 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
GAPVD1Q14C86 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
GAPVD1Q14C86 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
GAPVD1Q14C86 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
GAPVD1Q14C86 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
GAPVD1Q14C86 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
GAPVD1Q14C86 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
GAPVD1Q14C86 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
GAPVD1Q14C86 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC37.68■■■■□ 3.62
GAPVD1Q14C86 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.68■■■■□ 3.62
GAPVD1Q14C86 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
GAPVD1Q14C86 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
GAPVD1Q14C86 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
GAPVD1Q14C86 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC37.67■■■■□ 3.62
GAPVD1Q14C86 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC37.67■■■■□ 3.62
GAPVD1Q14C86 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.67■■■■□ 3.62
GAPVD1Q14C86 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
GAPVD1Q14C86 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC37.67■■■■□ 3.62
GAPVD1Q14C86 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
GAPVD1Q14C86 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
GAPVD1Q14C86 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
GAPVD1Q14C86 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
GAPVD1Q14C86 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
GAPVD1Q14C86 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
GAPVD1Q14C86 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC37.65■■■■□ 3.62
GAPVD1Q14C86 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC37.65■■■■□ 3.62
GAPVD1Q14C86 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC37.65■■■■□ 3.62
GAPVD1Q14C86 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
GAPVD1Q14C86 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
GAPVD1Q14C86 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
GAPVD1Q14C86 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC37.64■■■■□ 3.62
GAPVD1Q14C86 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
GAPVD1Q14C86 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
GAPVD1Q14C86 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.63■■■■□ 3.62
GAPVD1Q14C86 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
GAPVD1Q14C86 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC37.63■■■■□ 3.61
GAPVD1Q14C86 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC37.63■■■■□ 3.61
GAPVD1Q14C86 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC37.63■■■■□ 3.61
GAPVD1Q14C86 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
GAPVD1Q14C86 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC37.63■■■■□ 3.61
GAPVD1Q14C86 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC37.63■■■■□ 3.61
GAPVD1Q14C86 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
GAPVD1Q14C86 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
GAPVD1Q14C86 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC37.63■■■■□ 3.61
GAPVD1Q14C86 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
GAPVD1Q14C86 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC37.62■■■■□ 3.61
GAPVD1Q14C86 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
GAPVD1Q14C86 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
GAPVD1Q14C86 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC37.62■■■■□ 3.61
GAPVD1Q14C86 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
GAPVD1Q14C86 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
GAPVD1Q14C86 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
GAPVD1Q14C86 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
GAPVD1Q14C86 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
GAPVD1Q14C86 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
GAPVD1Q14C86 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC37.61■■■■□ 3.61
GAPVD1Q14C86 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC37.61■■■■□ 3.61
GAPVD1Q14C86 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
GAPVD1Q14C86 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
GAPVD1Q14C86 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.61■■■■□ 3.61
GAPVD1Q14C86 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
GAPVD1Q14C86 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
GAPVD1Q14C86 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC37.6■■■■□ 3.61
GAPVD1Q14C86 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
GAPVD1Q14C86 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
GAPVD1Q14C86 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
GAPVD1Q14C86 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
GAPVD1Q14C86 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
GAPVD1Q14C86 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC37.59■■■■□ 3.61
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