Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
AP3B2Q13367 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
AP3B2Q13367 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
AP3B2Q13367 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
AP3B2Q13367 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
AP3B2Q13367 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
AP3B2Q13367 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
AP3B2Q13367 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AP3B2Q13367 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AP3B2Q13367 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
AP3B2Q13367 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
AP3B2Q13367 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
AP3B2Q13367 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
AP3B2Q13367 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
AP3B2Q13367 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AP3B2Q13367 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
AP3B2Q13367 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
AP3B2Q13367 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
AP3B2Q13367 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
AP3B2Q13367 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
AP3B2Q13367 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
AP3B2Q13367 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
AP3B2Q13367 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
AP3B2Q13367 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
AP3B2Q13367 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AP3B2Q13367 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AP3B2Q13367 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AP3B2Q13367 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AP3B2Q13367 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AP3B2Q13367 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
AP3B2Q13367 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
AP3B2Q13367 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
AP3B2Q13367 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AP3B2Q13367 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
AP3B2Q13367 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
AP3B2Q13367 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
AP3B2Q13367 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
AP3B2Q13367 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
AP3B2Q13367 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
AP3B2Q13367 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
AP3B2Q13367 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
AP3B2Q13367 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
AP3B2Q13367 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
AP3B2Q13367 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
AP3B2Q13367 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
AP3B2Q13367 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
AP3B2Q13367 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
AP3B2Q13367 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
AP3B2Q13367 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
AP3B2Q13367 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
AP3B2Q13367 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
AP3B2Q13367 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
AP3B2Q13367 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
AP3B2Q13367 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
AP3B2Q13367 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
AP3B2Q13367 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
AP3B2Q13367 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
AP3B2Q13367 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
AP3B2Q13367 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
AP3B2Q13367 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
AP3B2Q13367 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
AP3B2Q13367 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
AP3B2Q13367 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
AP3B2Q13367 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
AP3B2Q13367 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
AP3B2Q13367 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
AP3B2Q13367 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
AP3B2Q13367 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
AP3B2Q13367 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
AP3B2Q13367 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
AP3B2Q13367 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
AP3B2Q13367 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
AP3B2Q13367 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
AP3B2Q13367 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
AP3B2Q13367 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
AP3B2Q13367 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
AP3B2Q13367 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
AP3B2Q13367 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
AP3B2Q13367 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
AP3B2Q13367 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
AP3B2Q13367 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
AP3B2Q13367 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
AP3B2Q13367 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
AP3B2Q13367 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
AP3B2Q13367 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
AP3B2Q13367 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
AP3B2Q13367 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
AP3B2Q13367 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
AP3B2Q13367 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
AP3B2Q13367 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
AP3B2Q13367 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
AP3B2Q13367 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
AP3B2Q13367 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
AP3B2Q13367 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
AP3B2Q13367 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
AP3B2Q13367 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
AP3B2Q13367 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
AP3B2Q13367 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
AP3B2Q13367 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
AP3B2Q13367 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
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