Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SRSF6Q13247 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SRSF6Q13247 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SRSF6Q13247 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SRSF6Q13247 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SRSF6Q13247 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SRSF6Q13247 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SRSF6Q13247 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SRSF6Q13247 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SRSF6Q13247 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SRSF6Q13247 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SRSF6Q13247 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SRSF6Q13247 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SRSF6Q13247 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SRSF6Q13247 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SRSF6Q13247 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SRSF6Q13247 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SRSF6Q13247 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SRSF6Q13247 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SRSF6Q13247 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SRSF6Q13247 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SRSF6Q13247 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SRSF6Q13247 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SRSF6Q13247 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SRSF6Q13247 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SRSF6Q13247 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SRSF6Q13247 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SRSF6Q13247 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SRSF6Q13247 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SRSF6Q13247 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SRSF6Q13247 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SRSF6Q13247 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SRSF6Q13247 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SRSF6Q13247 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SRSF6Q13247 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SRSF6Q13247 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SRSF6Q13247 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SRSF6Q13247 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SRSF6Q13247 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SRSF6Q13247 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SRSF6Q13247 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SRSF6Q13247 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SRSF6Q13247 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SRSF6Q13247 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SRSF6Q13247 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SRSF6Q13247 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SRSF6Q13247 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SRSF6Q13247 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SRSF6Q13247 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SRSF6Q13247 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SRSF6Q13247 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SRSF6Q13247 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SRSF6Q13247 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SRSF6Q13247 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SRSF6Q13247 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SRSF6Q13247 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SRSF6Q13247 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SRSF6Q13247 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SRSF6Q13247 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SRSF6Q13247 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SRSF6Q13247 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SRSF6Q13247 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SRSF6Q13247 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SRSF6Q13247 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SRSF6Q13247 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SRSF6Q13247 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SRSF6Q13247 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SRSF6Q13247 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SRSF6Q13247 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SRSF6Q13247 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SRSF6Q13247 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SRSF6Q13247 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SRSF6Q13247 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SRSF6Q13247 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SRSF6Q13247 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SRSF6Q13247 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SRSF6Q13247 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SRSF6Q13247 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SRSF6Q13247 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SRSF6Q13247 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SRSF6Q13247 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SRSF6Q13247 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SRSF6Q13247 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SRSF6Q13247 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SRSF6Q13247 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SRSF6Q13247 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SRSF6Q13247 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SRSF6Q13247 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SRSF6Q13247 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SRSF6Q13247 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SRSF6Q13247 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SRSF6Q13247 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SRSF6Q13247 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SRSF6Q13247 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SRSF6Q13247 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SRSF6Q13247 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SRSF6Q13247 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SRSF6Q13247 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SRSF6Q13247 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SRSF6Q13247 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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