Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CXCL9Q07325 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CXCL9Q07325 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CXCL9Q07325 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CXCL9Q07325 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CXCL9Q07325 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CXCL9Q07325 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CXCL9Q07325 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CXCL9Q07325 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CXCL9Q07325 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CXCL9Q07325 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CXCL9Q07325 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CXCL9Q07325 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CXCL9Q07325 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CXCL9Q07325 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CXCL9Q07325 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CXCL9Q07325 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CXCL9Q07325 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CXCL9Q07325 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CXCL9Q07325 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CXCL9Q07325 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CXCL9Q07325 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CXCL9Q07325 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CXCL9Q07325 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CXCL9Q07325 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CXCL9Q07325 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CXCL9Q07325 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CXCL9Q07325 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CXCL9Q07325 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CXCL9Q07325 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CXCL9Q07325 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CXCL9Q07325 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CXCL9Q07325 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CXCL9Q07325 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CXCL9Q07325 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CXCL9Q07325 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CXCL9Q07325 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CXCL9Q07325 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CXCL9Q07325 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CXCL9Q07325 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CXCL9Q07325 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CXCL9Q07325 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CXCL9Q07325 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CXCL9Q07325 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CXCL9Q07325 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CXCL9Q07325 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CXCL9Q07325 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CXCL9Q07325 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CXCL9Q07325 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CXCL9Q07325 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CXCL9Q07325 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CXCL9Q07325 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CXCL9Q07325 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CXCL9Q07325 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CXCL9Q07325 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CXCL9Q07325 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CXCL9Q07325 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CXCL9Q07325 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CXCL9Q07325 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CXCL9Q07325 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CXCL9Q07325 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CXCL9Q07325 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CXCL9Q07325 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CXCL9Q07325 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CXCL9Q07325 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CXCL9Q07325 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CXCL9Q07325 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CXCL9Q07325 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CXCL9Q07325 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CXCL9Q07325 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CXCL9Q07325 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CXCL9Q07325 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CXCL9Q07325 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CXCL9Q07325 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CXCL9Q07325 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CXCL9Q07325 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CXCL9Q07325 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CXCL9Q07325 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CXCL9Q07325 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CXCL9Q07325 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CXCL9Q07325 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CXCL9Q07325 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CXCL9Q07325 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CXCL9Q07325 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CXCL9Q07325 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CXCL9Q07325 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CXCL9Q07325 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CXCL9Q07325 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CXCL9Q07325 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CXCL9Q07325 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CXCL9Q07325 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CXCL9Q07325 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CXCL9Q07325 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CXCL9Q07325 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CXCL9Q07325 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CXCL9Q07325 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CXCL9Q07325 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CXCL9Q07325 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CXCL9Q07325 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CXCL9Q07325 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms