Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smarcad1Q04692 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smarcad1Q04692 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smarcad1Q04692 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smarcad1Q04692 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smarcad1Q04692 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smarcad1Q04692 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smarcad1Q04692 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smarcad1Q04692 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smarcad1Q04692 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smarcad1Q04692 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smarcad1Q04692 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smarcad1Q04692 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smarcad1Q04692 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smarcad1Q04692 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smarcad1Q04692 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smarcad1Q04692 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smarcad1Q04692 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Smarcad1Q04692 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Smarcad1Q04692 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smarcad1Q04692 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smarcad1Q04692 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smarcad1Q04692 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smarcad1Q04692 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smarcad1Q04692 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smarcad1Q04692 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smarcad1Q04692 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smarcad1Q04692 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smarcad1Q04692 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smarcad1Q04692 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Smarcad1Q04692 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smarcad1Q04692 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Smarcad1Q04692 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smarcad1Q04692 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smarcad1Q04692 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smarcad1Q04692 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smarcad1Q04692 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smarcad1Q04692 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Smarcad1Q04692 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smarcad1Q04692 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Smarcad1Q04692 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smarcad1Q04692 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smarcad1Q04692 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smarcad1Q04692 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smarcad1Q04692 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smarcad1Q04692 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smarcad1Q04692 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smarcad1Q04692 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smarcad1Q04692 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smarcad1Q04692 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Smarcad1Q04692 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Smarcad1Q04692 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Smarcad1Q04692 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smarcad1Q04692 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smarcad1Q04692 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smarcad1Q04692 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smarcad1Q04692 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smarcad1Q04692 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smarcad1Q04692 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smarcad1Q04692 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smarcad1Q04692 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smarcad1Q04692 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smarcad1Q04692 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smarcad1Q04692 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smarcad1Q04692 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smarcad1Q04692 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smarcad1Q04692 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smarcad1Q04692 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smarcad1Q04692 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smarcad1Q04692 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smarcad1Q04692 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smarcad1Q04692 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smarcad1Q04692 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smarcad1Q04692 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smarcad1Q04692 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smarcad1Q04692 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smarcad1Q04692 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smarcad1Q04692 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smarcad1Q04692 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smarcad1Q04692 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smarcad1Q04692 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smarcad1Q04692 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Smarcad1Q04692 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smarcad1Q04692 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smarcad1Q04692 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smarcad1Q04692 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smarcad1Q04692 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smarcad1Q04692 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smarcad1Q04692 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smarcad1Q04692 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smarcad1Q04692 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smarcad1Q04692 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smarcad1Q04692 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smarcad1Q04692 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smarcad1Q04692 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smarcad1Q04692 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smarcad1Q04692 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smarcad1Q04692 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smarcad1Q04692 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Smarcad1Q04692 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms