Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SIM1P81133 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIM1P81133 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIM1P81133 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIM1P81133 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIM1P81133 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIM1P81133 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIM1P81133 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIM1P81133 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIM1P81133 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIM1P81133 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SIM1P81133 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIM1P81133 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIM1P81133 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIM1P81133 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIM1P81133 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIM1P81133 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIM1P81133 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIM1P81133 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIM1P81133 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIM1P81133 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIM1P81133 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIM1P81133 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIM1P81133 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIM1P81133 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIM1P81133 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIM1P81133 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SIM1P81133 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIM1P81133 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIM1P81133 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIM1P81133 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIM1P81133 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIM1P81133 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIM1P81133 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIM1P81133 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIM1P81133 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIM1P81133 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIM1P81133 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIM1P81133 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIM1P81133 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIM1P81133 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIM1P81133 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIM1P81133 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIM1P81133 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIM1P81133 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIM1P81133 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SIM1P81133 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIM1P81133 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SIM1P81133 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SIM1P81133 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SIM1P81133 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SIM1P81133 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SIM1P81133 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SIM1P81133 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SIM1P81133 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SIM1P81133 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SIM1P81133 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIM1P81133 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIM1P81133 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIM1P81133 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIM1P81133 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIM1P81133 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIM1P81133 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIM1P81133 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIM1P81133 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIM1P81133 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIM1P81133 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIM1P81133 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIM1P81133 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIM1P81133 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIM1P81133 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIM1P81133 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIM1P81133 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIM1P81133 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIM1P81133 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIM1P81133 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIM1P81133 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIM1P81133 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIM1P81133 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SIM1P81133 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIM1P81133 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIM1P81133 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIM1P81133 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIM1P81133 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIM1P81133 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIM1P81133 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIM1P81133 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIM1P81133 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SIM1P81133 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIM1P81133 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIM1P81133 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIM1P81133 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIM1P81133 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIM1P81133 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIM1P81133 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIM1P81133 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIM1P81133 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SIM1P81133 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIM1P81133 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIM1P81133 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms