Protein–RNA interactions for Protein: P81117

Nucb2, Nucleobindin-2, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nucb2P81117 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nucb2P81117 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nucb2P81117 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nucb2P81117 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Nucb2P81117 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nucb2P81117 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nucb2P81117 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nucb2P81117 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nucb2P81117 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nucb2P81117 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nucb2P81117 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nucb2P81117 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nucb2P81117 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nucb2P81117 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nucb2P81117 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nucb2P81117 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nucb2P81117 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nucb2P81117 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nucb2P81117 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nucb2P81117 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nucb2P81117 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nucb2P81117 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nucb2P81117 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nucb2P81117 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nucb2P81117 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nucb2P81117 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nucb2P81117 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nucb2P81117 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nucb2P81117 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nucb2P81117 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nucb2P81117 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nucb2P81117 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nucb2P81117 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nucb2P81117 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nucb2P81117 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nucb2P81117 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nucb2P81117 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nucb2P81117 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nucb2P81117 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nucb2P81117 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nucb2P81117 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nucb2P81117 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nucb2P81117 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nucb2P81117 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nucb2P81117 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nucb2P81117 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nucb2P81117 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nucb2P81117 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nucb2P81117 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nucb2P81117 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nucb2P81117 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nucb2P81117 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nucb2P81117 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nucb2P81117 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nucb2P81117 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nucb2P81117 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nucb2P81117 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nucb2P81117 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nucb2P81117 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nucb2P81117 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nucb2P81117 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nucb2P81117 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nucb2P81117 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nucb2P81117 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nucb2P81117 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nucb2P81117 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nucb2P81117 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nucb2P81117 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nucb2P81117 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nucb2P81117 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nucb2P81117 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nucb2P81117 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nucb2P81117 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nucb2P81117 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nucb2P81117 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nucb2P81117 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nucb2P81117 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nucb2P81117 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nucb2P81117 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nucb2P81117 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nucb2P81117 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nucb2P81117 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nucb2P81117 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nucb2P81117 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nucb2P81117 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nucb2P81117 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nucb2P81117 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Nucb2P81117 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nucb2P81117 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nucb2P81117 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nucb2P81117 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nucb2P81117 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nucb2P81117 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nucb2P81117 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nucb2P81117 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nucb2P81117 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nucb2P81117 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nucb2P81117 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nucb2P81117 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nucb2P81117 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms