Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
GTF2A2P52657 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
GTF2A2P52657 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
GTF2A2P52657 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GTF2A2P52657 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GTF2A2P52657 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GTF2A2P52657 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GTF2A2P52657 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GTF2A2P52657 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GTF2A2P52657 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GTF2A2P52657 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GTF2A2P52657 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GTF2A2P52657 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GTF2A2P52657 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GTF2A2P52657 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GTF2A2P52657 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GTF2A2P52657 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GTF2A2P52657 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GTF2A2P52657 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GTF2A2P52657 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GTF2A2P52657 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GTF2A2P52657 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GTF2A2P52657 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GTF2A2P52657 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GTF2A2P52657 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GTF2A2P52657 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GTF2A2P52657 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GTF2A2P52657 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GTF2A2P52657 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GTF2A2P52657 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GTF2A2P52657 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GTF2A2P52657 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GTF2A2P52657 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GTF2A2P52657 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GTF2A2P52657 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GTF2A2P52657 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GTF2A2P52657 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GTF2A2P52657 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GTF2A2P52657 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GTF2A2P52657 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GTF2A2P52657 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GTF2A2P52657 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GTF2A2P52657 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GTF2A2P52657 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
GTF2A2P52657 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GTF2A2P52657 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GTF2A2P52657 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GTF2A2P52657 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GTF2A2P52657 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GTF2A2P52657 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GTF2A2P52657 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GTF2A2P52657 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GTF2A2P52657 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GTF2A2P52657 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
GTF2A2P52657 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GTF2A2P52657 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GTF2A2P52657 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GTF2A2P52657 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GTF2A2P52657 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
GTF2A2P52657 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GTF2A2P52657 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GTF2A2P52657 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GTF2A2P52657 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
GTF2A2P52657 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GTF2A2P52657 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GTF2A2P52657 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GTF2A2P52657 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GTF2A2P52657 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GTF2A2P52657 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GTF2A2P52657 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GTF2A2P52657 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GTF2A2P52657 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GTF2A2P52657 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GTF2A2P52657 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GTF2A2P52657 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GTF2A2P52657 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GTF2A2P52657 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GTF2A2P52657 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GTF2A2P52657 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GTF2A2P52657 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GTF2A2P52657 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GTF2A2P52657 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GTF2A2P52657 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GTF2A2P52657 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GTF2A2P52657 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GTF2A2P52657 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GTF2A2P52657 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GTF2A2P52657 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GTF2A2P52657 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GTF2A2P52657 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GTF2A2P52657 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GTF2A2P52657 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GTF2A2P52657 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GTF2A2P52657 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GTF2A2P52657 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GTF2A2P52657 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
GTF2A2P52657 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GTF2A2P52657 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GTF2A2P52657 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GTF2A2P52657 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms