Protein–RNA interactions for Protein: P40337

VHL, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VHLP40337 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VHLP40337 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VHLP40337 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VHLP40337 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VHLP40337 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VHLP40337 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VHLP40337 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VHLP40337 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VHLP40337 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VHLP40337 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VHLP40337 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VHLP40337 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VHLP40337 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VHLP40337 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VHLP40337 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VHLP40337 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VHLP40337 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VHLP40337 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VHLP40337 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VHLP40337 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VHLP40337 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VHLP40337 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VHLP40337 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VHLP40337 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VHLP40337 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VHLP40337 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VHLP40337 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VHLP40337 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VHLP40337 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
VHLP40337 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
VHLP40337 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VHLP40337 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VHLP40337 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VHLP40337 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VHLP40337 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VHLP40337 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VHLP40337 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
VHLP40337 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VHLP40337 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VHLP40337 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VHLP40337 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VHLP40337 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VHLP40337 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VHLP40337 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VHLP40337 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VHLP40337 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VHLP40337 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VHLP40337 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VHLP40337 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VHLP40337 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VHLP40337 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VHLP40337 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VHLP40337 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VHLP40337 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VHLP40337 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VHLP40337 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VHLP40337 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VHLP40337 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VHLP40337 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VHLP40337 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VHLP40337 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VHLP40337 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VHLP40337 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VHLP40337 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
VHLP40337 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VHLP40337 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VHLP40337 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VHLP40337 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VHLP40337 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VHLP40337 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VHLP40337 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VHLP40337 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VHLP40337 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VHLP40337 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VHLP40337 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VHLP40337 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VHLP40337 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VHLP40337 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VHLP40337 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VHLP40337 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VHLP40337 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VHLP40337 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VHLP40337 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VHLP40337 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VHLP40337 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VHLP40337 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VHLP40337 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VHLP40337 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VHLP40337 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VHLP40337 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VHLP40337 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VHLP40337 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VHLP40337 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VHLP40337 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VHLP40337 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VHLP40337 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VHLP40337 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VHLP40337 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VHLP40337 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VHLP40337 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms