Protein–RNA interactions for Protein: P40087

DDI1, DNA damage-inducible protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DDI1P40087 RKM2YDR198C 1440 nt4.3□□□□□ -1.72
DDI1P40087 LPL1YOR059C 1353 nt4.3□□□□□ -1.72
DDI1P40087 RTC5YOR118W 1704 nt4.3□□□□□ -1.72
DDI1P40087 KNH1YDL049C 807 nt4.3□□□□□ -1.72
DDI1P40087 SNM1YDR478W 597 nt4.3□□□□□ -1.72
DDI1P40087 SYN8YAL014C 768 nt4.3□□□□□ -1.72
DDI1P40087 YBL006W-AYBL006W-A 150 nt4.3□□□□□ -1.72
DDI1P40087 YMR082CYMR082C 357 nt4.3□□□□□ -1.72
DDI1P40087 HSP26YBR072W 645 nt4.3□□□□□ -1.72
DDI1P40087 POP4YBR257W 840 nt4.3□□□□□ -1.72
DDI1P40087 KGD1YIL125W 3045 nt4.3□□□□□ -1.72
DDI1P40087 TEA1YOR337W 2280 nt4.3□□□□□ -1.72
DDI1P40087 LDB17YDL146W 1476 nt4.3□□□□□ -1.72
DDI1P40087 IBA57YJR122W 1494 nt4.3□□□□□ -1.72
DDI1P40087 TGL4YKR089C 2733 nt4.3□□□□□ -1.72
DDI1P40087 PAH1YMR165C 2589 nt4.29□□□□□ -1.72
DDI1P40087 IZH3YLR023C 1632 nt4.29□□□□□ -1.72
DDI1P40087 YDL124WYDL124W 939 nt4.29□□□□□ -1.72
DDI1P40087 GCV1YDR019C 1203 nt4.29□□□□□ -1.72
DDI1P40087 NOP16YER002W 696 nt4.29□□□□□ -1.72
DDI1P40087 ACT1YFL039C 1128 nt4.29□□□□□ -1.72
DDI1P40087 YFL064CYFL064C 525 nt4.29□□□□□ -1.72
DDI1P40087 MLC1YGL106W 450 nt4.29□□□□□ -1.72
DDI1P40087 YMR315WYMR315W 1050 nt4.29□□□□□ -1.72
DDI1P40087 YPL077CYPL077C 723 nt4.29□□□□□ -1.72
DDI1P40087 YPR202WYPR202W 717 nt4.29□□□□□ -1.72
DDI1P40087 snR7-SsnR7-S 179 nt4.28□□□□□ -1.72
DDI1P40087 BGL2YGR282C 942 nt4.28□□□□□ -1.72
DDI1P40087 GON7YJL184W 372 nt4.28□□□□□ -1.72
DDI1P40087 YAL047W-AYAL047W-A 330 nt4.28□□□□□ -1.72
DDI1P40087 SAM4YPL273W 978 nt4.28□□□□□ -1.72
DDI1P40087 HIR2YOR038C 2628 nt4.28□□□□□ -1.72
DDI1P40087 HFA1YMR207C 6372 nt4.28□□□□□ -1.72
DDI1P40087 AVT1YJR001W 1809 nt4.28□□□□□ -1.72
DDI1P40087 LAS21YJL062W 2493 nt4.27□□□□□ -1.73
DDI1P40087 MNN10YDR245W 1182 nt4.27□□□□□ -1.73
DDI1P40087 YGR011WYGR011W 327 nt4.27□□□□□ -1.73
DDI1P40087 YJR012CYJR012C 624 nt4.27□□□□□ -1.73
DDI1P40087 ISA1YLL027W 753 nt4.27□□□□□ -1.73
DDI1P40087 YML119WYML119W 1074 nt4.27□□□□□ -1.73
DDI1P40087 YPR169W-AYPR169W-A 219 nt4.27□□□□□ -1.73
DDI1P40087 YPR170W-BYPR170W-B 258 nt4.27□□□□□ -1.73
DDI1P40087 SYP1YCR030C 2613 nt4.27□□□□□ -1.73
DDI1P40087 GMC1YDR506C 1827 nt4.27□□□□□ -1.73
DDI1P40087 TOG1YER184C 2385 nt4.27□□□□□ -1.73
DDI1P40087 RAD1YPL022W 3303 nt4.27□□□□□ -1.73
DDI1P40087 PUT1YLR142W 1431 nt4.27□□□□□ -1.73
DDI1P40087 ARG4YHR018C 1392 nt4.27□□□□□ -1.73
DDI1P40087 ALG2YGL065C 1512 nt4.26□□□□□ -1.73
DDI1P40087 TFG1YGR186W 2208 nt4.26□□□□□ -1.73
DDI1P40087 PER1YCR044C 1074 nt4.26□□□□□ -1.73
DDI1P40087 RNA15YGL044C 891 nt4.26□□□□□ -1.73
DDI1P40087 YGR182CYGR182C 354 nt4.26□□□□□ -1.73
DDI1P40087 YLR194CYLR194C 765 nt4.26□□□□□ -1.73
DDI1P40087 CDC42YLR229C 576 nt4.26□□□□□ -1.73
DDI1P40087 YBR196C-BYBR196C-B 105 nt4.26□□□□□ -1.73
DDI1P40087 UPC2YDR213W 2742 nt4.26□□□□□ -1.73
DDI1P40087 KCC4YCL024W 3114 nt4.25□□□□□ -1.73
DDI1P40087 YDR134CYDR134C 411 nt4.25□□□□□ -1.73
DDI1P40087 MHR1YDR296W 681 nt4.25□□□□□ -1.73
DDI1P40087 OMS1YDR316W 1416 nt4.25□□□□□ -1.73
DDI1P40087 AIM10YER087W 1731 nt4.25□□□□□ -1.73
DDI1P40087 GAT4YIR013C 366 nt4.25□□□□□ -1.73
DDI1P40087 YJL218WYJL218W 591 nt4.25□□□□□ -1.73
DDI1P40087 YLR125WYLR125W 411 nt4.25□□□□□ -1.73
DDI1P40087 NAT5YOR253W 531 nt4.25□□□□□ -1.73
DDI1P40087 LYS2YBR115C 4179 nt4.25□□□□□ -1.73
DDI1P40087 COT1YOR316C 1320 nt4.24□□□□□ -1.73
DDI1P40087 YFR034W-AYFR034W-A 288 nt4.24□□□□□ -1.73
DDI1P40087 LDB18YLL049W 540 nt4.24□□□□□ -1.73
DDI1P40087 YNL067W-AYNL067W-A 147 nt4.24□□□□□ -1.73
DDI1P40087 SLZ1YNL196C 897 nt4.24□□□□□ -1.73
DDI1P40087 TOM5YPR133W-A 153 nt4.24□□□□□ -1.73
DDI1P40087 YCL022CYCL022C 516 nt4.24□□□□□ -1.73
DDI1P40087 RPN12YFR052W 825 nt4.23□□□□□ -1.73
DDI1P40087 TIP20YGL145W 2106 nt4.23□□□□□ -1.73
DDI1P40087 YIR043CYIR043C 693 nt4.23□□□□□ -1.73
DDI1P40087 ERG3YLR056W 1098 nt4.23□□□□□ -1.73
DDI1P40087 YAR019W-AYAR019W-A 333 nt4.23□□□□□ -1.73
DDI1P40087 PNP1YLR209C 936 nt4.23□□□□□ -1.73
DDI1P40087 RSA3YLR221C 663 nt4.23□□□□□ -1.73
DDI1P40087 YNL134CYNL134C 1131 nt4.23□□□□□ -1.73
DDI1P40087 NOP13YNL175C 1212 nt4.23□□□□□ -1.73
DDI1P40087 YPL199CYPL199C 723 nt4.23□□□□□ -1.73
DDI1P40087 OPY2YPR075C 1083 nt4.23□□□□□ -1.73
DDI1P40087 BUD7YOR299W 2241 nt4.23□□□□□ -1.73
DDI1P40087 APC4YDR118W 1959 nt4.23□□□□□ -1.73
DDI1P40087 ZPR1YGR211W 1461 nt4.23□□□□□ -1.73
DDI1P40087 YDR445CYDR445C 408 nt4.22□□□□□ -1.73
DDI1P40087 DCD1YHR144C 939 nt4.22□□□□□ -1.73
DDI1P40087 NVJ1YHR195W 966 nt4.22□□□□□ -1.73
DDI1P40087 XKS1YGR194C 1803 nt4.22□□□□□ -1.73
DDI1P40087 YDL109CYDL109C 1944 nt4.22□□□□□ -1.73
DDI1P40087 SAP4YGL229C 2457 nt4.22□□□□□ -1.73
DDI1P40087 MAD3YJL013C 1548 nt4.21□□□□□ -1.73
DDI1P40087 DIT1YDR403W 1611 nt4.21□□□□□ -1.73
DDI1P40087 SPR28YDR218C 1272 nt4.21□□□□□ -1.74
DDI1P40087 UBI4YLL039C 1146 nt4.21□□□□□ -1.74
DDI1P40087 YLR283WYLR283W 945 nt4.21□□□□□ -1.74
DDI1P40087 FBP1YLR377C 1047 nt4.21□□□□□ -1.74
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14 ms