Protein–RNA interactions for Protein: P38129

TAF5, Transcription initiation factor TFIID subunit 5, yeastyeast

Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TAF5P38129 SWC3YAL011W 1878 nt5.93□□□□□ -1.46
TAF5P38129 CCZ1YBR131W 2115 nt5.93□□□□□ -1.46
TAF5P38129 YMR221CYMR221C 1515 nt5.93□□□□□ -1.46
TAF5P38129 PHM7YOL084W 2976 nt5.92□□□□□ -1.46
TAF5P38129 CAB3YKL088W 1716 nt5.92□□□□□ -1.46
TAF5P38129 FLO8YER109C 2400 nt5.92□□□□□ -1.46
TAF5P38129 AIM7YDR063W 450 nt5.92□□□□□ -1.46
TAF5P38129 RTN1YDR233C 888 nt5.92□□□□□ -1.46
TAF5P38129 YLL017WYLL017W 312 nt5.92□□□□□ -1.46
TAF5P38129 YNL234WYNL234W 1281 nt5.92□□□□□ -1.46
TAF5P38129 RPL19AYBR084C-A 570 nt5.92□□□□□ -1.46
TAF5P38129 YMD8YML038C 1329 nt5.92□□□□□ -1.46
TAF5P38129 EUG1YDR518W 1554 nt5.92□□□□□ -1.46
TAF5P38129 MAL13YGR288W 1422 nt5.91□□□□□ -1.46
TAF5P38129 THS1YIL078W 2205 nt5.91□□□□□ -1.46
TAF5P38129 HNT2YDR305C 654 nt5.91□□□□□ -1.46
TAF5P38129 UBP9YER098W 2265 nt5.91□□□□□ -1.46
TAF5P38129 VID22YLR373C 2706 nt5.9□□□□□ -1.46
TAF5P38129 CNB1YKL190W 528 nt5.9□□□□□ -1.46
TAF5P38129 NKP2YLR315W 462 nt5.9□□□□□ -1.46
TAF5P38129 OSW5YMR148W 447 nt5.9□□□□□ -1.46
TAF5P38129 PDX3YBR035C 687 nt5.9□□□□□ -1.46
TAF5P38129 MKC7YDR144C 1791 nt5.9□□□□□ -1.47
TAF5P38129 CTF18YMR078C 2226 nt5.9□□□□□ -1.47
TAF5P38129 PCL9YDL179W 915 nt5.89□□□□□ -1.47
TAF5P38129 YDR545C-AYDR545C-A 480 nt5.89□□□□□ -1.47
TAF5P38129 YEL077W-AYEL077W-A 483 nt5.89□□□□□ -1.47
TAF5P38129 YER190C-BYER190C-B 483 nt5.89□□□□□ -1.47
TAF5P38129 SUP56tL(CAA)A 82 nt5.89□□□□□ -1.47
TAF5P38129 SUP53tL(CAA)C 82 nt5.89□□□□□ -1.47
TAF5P38129 YFL068WYFL068W 483 nt5.89□□□□□ -1.47
TAF5P38129 tL(CAA)DtL(CAA)D 82 nt5.89□□□□□ -1.47
TAF5P38129 tL(CAA)G1tL(CAA)G1 82 nt5.89□□□□□ -1.47
TAF5P38129 SUP54tL(CAA)G2 82 nt5.89□□□□□ -1.47
TAF5P38129 tL(CAA)G3tL(CAA)G3 82 nt5.89□□□□□ -1.47
TAF5P38129 tL(CAA)KtL(CAA)K 82 nt5.89□□□□□ -1.47
TAF5P38129 tL(CAA)LtL(CAA)L 82 nt5.89□□□□□ -1.47
TAF5P38129 tL(CAA)MtL(CAA)M 82 nt5.89□□□□□ -1.47
TAF5P38129 tL(CAA)NtL(CAA)N 82 nt5.89□□□□□ -1.47
TAF5P38129 SPO74YGL170C 1242 nt5.89□□□□□ -1.47
TAF5P38129 YGR296C-BYGR296C-B 483 nt5.89□□□□□ -1.47
TAF5P38129 YHL050W-AYHL050W-A 483 nt5.89□□□□□ -1.47
TAF5P38129 RPS4BYHR203C 786 nt5.89□□□□□ -1.47
TAF5P38129 YHR219C-AYHR219C-A 483 nt5.89□□□□□ -1.47
TAF5P38129 RHO3YIL118W 696 nt5.89□□□□□ -1.47
TAF5P38129 YIL177W-AYIL177W-A 483 nt5.89□□□□□ -1.47
TAF5P38129 YJL225W-AYJL225W-A 483 nt5.89□□□□□ -1.47
TAF5P38129 RPS4AYJR145C 786 nt5.89□□□□□ -1.47
TAF5P38129 FMP46YKR049C 402 nt5.89□□□□□ -1.47
TAF5P38129 YLL066W-AYLL066W-A 483 nt5.89□□□□□ -1.47
TAF5P38129 YLL067W-AYLL067W-A 483 nt5.89□□□□□ -1.47
TAF5P38129 YLR466C-AYLR466C-A 483 nt5.89□□□□□ -1.47
TAF5P38129 YLR467C-AYLR467C-A 483 nt5.89□□□□□ -1.47
TAF5P38129 YML133W-BYML133W-B 483 nt5.89□□□□□ -1.47
TAF5P38129 YBL029WYBL029W 1131 nt5.89□□□□□ -1.47
TAF5P38129 PPA2YMR267W 933 nt5.89□□□□□ -1.47
TAF5P38129 YNL108CYNL108C 813 nt5.89□□□□□ -1.47
TAF5P38129 YNL339W-BYNL339W-B 483 nt5.89□□□□□ -1.47
TAF5P38129 YBL113W-AYBL113W-A 483 nt5.89□□□□□ -1.47
TAF5P38129 YOR396C-AYOR396C-A 483 nt5.89□□□□□ -1.47
TAF5P38129 SNF8YPL002C 702 nt5.89□□□□□ -1.47
TAF5P38129 YPL283W-BYPL283W-B 483 nt5.89□□□□□ -1.47
TAF5P38129 YPR204C-AYPR204C-A 483 nt5.89□□□□□ -1.47
TAF5P38129 MNN4YKL201C 3537 nt5.89□□□□□ -1.47
TAF5P38129 DHH1YDL160C 1521 nt5.89□□□□□ -1.47
TAF5P38129 CST6YIL036W 1764 nt5.88□□□□□ -1.47
TAF5P38129 COQ4YDR204W 1008 nt5.88□□□□□ -1.47
TAF5P38129 LSM6YDR378C 261 nt5.88□□□□□ -1.47
TAF5P38129 YDR396WYDR396W 501 nt5.88□□□□□ -1.47
TAF5P38129 PSR1YLL010C 1284 nt5.88□□□□□ -1.47
TAF5P38129 YMR135W-AYMR135W-A 534 nt5.88□□□□□ -1.47
TAF5P38129 YLH47YPR125W 1365 nt5.88□□□□□ -1.47
TAF5P38129 IMD2YHR216W 1572 nt5.88□□□□□ -1.47
TAF5P38129 MPS3YJL019W 2049 nt5.87□□□□□ -1.47
TAF5P38129 ASK10YGR097W 3441 nt5.87□□□□□ -1.47
TAF5P38129 NTR2YKR022C 969 nt5.87□□□□□ -1.47
TAF5P38129 PPG1YNR032W 1107 nt5.87□□□□□ -1.47
TAF5P38129 COX11YPL132W 903 nt5.87□□□□□ -1.47
TAF5P38129 YIL001WYIL001W 1542 nt5.87□□□□□ -1.47
TAF5P38129 GIP2YER054C 1647 nt5.87□□□□□ -1.47
TAF5P38129 JHD2YJR119C 2187 nt5.87□□□□□ -1.47
TAF5P38129 RAD53YPL153C 2466 nt5.87□□□□□ -1.47
TAF5P38129 PAN1YIR006C 4443 nt5.86□□□□□ -1.47
TAF5P38129 PAF1YBR279W 1338 nt5.86□□□□□ -1.47
TAF5P38129 RCR2YDR003W 633 nt5.86□□□□□ -1.47
TAF5P38129 YFR052C-AYFR052C-A 306 nt5.86□□□□□ -1.47
TAF5P38129 COX17YLL009C 210 nt5.86□□□□□ -1.47
TAF5P38129 ARR1YPR199C 885 nt5.86□□□□□ -1.47
TAF5P38129 VAN1YML115C 1608 nt5.85□□□□□ -1.47
TAF5P38129 GCR1YPL075W 2358 nt5.85□□□□□ -1.47
TAF5P38129 TMA17YDL110C 453 nt5.85□□□□□ -1.47
TAF5P38129 SNM1YDR478W 597 nt5.85□□□□□ -1.47
TAF5P38129 BUD16YEL029C 939 nt5.85□□□□□ -1.47
TAF5P38129 YLR402WYLR402W 192 nt5.85□□□□□ -1.47
TAF5P38129 SUL2YLR092W 2682 nt5.84□□□□□ -1.47
TAF5P38129 LAP2YNL045W 2016 nt5.84□□□□□ -1.47
TAF5P38129 FRE7YOL152W 1863 nt5.84□□□□□ -1.47
TAF5P38129 MTM1YGR257C 1101 nt5.84□□□□□ -1.47
TAF5P38129 REX3YLR107W 1215 nt5.84□□□□□ -1.47
TAF5P38129 FBP1YLR377C 1047 nt5.84□□□□□ -1.47
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