Protein–RNA interactions for Protein: P36382

GJA5, Gap junction alpha-5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA5P36382 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GJA5P36382 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GJA5P36382 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GJA5P36382 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GJA5P36382 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GJA5P36382 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
GJA5P36382 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GJA5P36382 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GJA5P36382 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GJA5P36382 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GJA5P36382 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GJA5P36382 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GJA5P36382 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GJA5P36382 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GJA5P36382 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GJA5P36382 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GJA5P36382 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GJA5P36382 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GJA5P36382 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GJA5P36382 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GJA5P36382 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GJA5P36382 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GJA5P36382 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GJA5P36382 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GJA5P36382 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GJA5P36382 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GJA5P36382 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GJA5P36382 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GJA5P36382 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GJA5P36382 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GJA5P36382 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
GJA5P36382 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
GJA5P36382 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GJA5P36382 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GJA5P36382 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GJA5P36382 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
GJA5P36382 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
GJA5P36382 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GJA5P36382 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GJA5P36382 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GJA5P36382 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GJA5P36382 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GJA5P36382 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GJA5P36382 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GJA5P36382 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GJA5P36382 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GJA5P36382 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GJA5P36382 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GJA5P36382 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
GJA5P36382 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GJA5P36382 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GJA5P36382 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
GJA5P36382 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GJA5P36382 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GJA5P36382 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GJA5P36382 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GJA5P36382 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GJA5P36382 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GJA5P36382 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GJA5P36382 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GJA5P36382 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GJA5P36382 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GJA5P36382 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GJA5P36382 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
GJA5P36382 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GJA5P36382 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GJA5P36382 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GJA5P36382 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GJA5P36382 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GJA5P36382 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GJA5P36382 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GJA5P36382 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GJA5P36382 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GJA5P36382 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GJA5P36382 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GJA5P36382 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GJA5P36382 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GJA5P36382 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GJA5P36382 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GJA5P36382 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GJA5P36382 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GJA5P36382 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GJA5P36382 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GJA5P36382 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
GJA5P36382 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GJA5P36382 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GJA5P36382 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GJA5P36382 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GJA5P36382 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GJA5P36382 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GJA5P36382 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GJA5P36382 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GJA5P36382 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GJA5P36382 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GJA5P36382 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GJA5P36382 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GJA5P36382 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GJA5P36382 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GJA5P36382 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GJA5P36382 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms