Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXD13P35453 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXD13P35453 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXD13P35453 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXD13P35453 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXD13P35453 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXD13P35453 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXD13P35453 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXD13P35453 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXD13P35453 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXD13P35453 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXD13P35453 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXD13P35453 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXD13P35453 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXD13P35453 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXD13P35453 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXD13P35453 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXD13P35453 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXD13P35453 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXD13P35453 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXD13P35453 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXD13P35453 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
HOXD13P35453 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
HOXD13P35453 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXD13P35453 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXD13P35453 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXD13P35453 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXD13P35453 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXD13P35453 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXD13P35453 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXD13P35453 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXD13P35453 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXD13P35453 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXD13P35453 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXD13P35453 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXD13P35453 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXD13P35453 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXD13P35453 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXD13P35453 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXD13P35453 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXD13P35453 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXD13P35453 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXD13P35453 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXD13P35453 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXD13P35453 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXD13P35453 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXD13P35453 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXD13P35453 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXD13P35453 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXD13P35453 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXD13P35453 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXD13P35453 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXD13P35453 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXD13P35453 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXD13P35453 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXD13P35453 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXD13P35453 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXD13P35453 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXD13P35453 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXD13P35453 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXD13P35453 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXD13P35453 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXD13P35453 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXD13P35453 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXD13P35453 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXD13P35453 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXD13P35453 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXD13P35453 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXD13P35453 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXD13P35453 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXD13P35453 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXD13P35453 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXD13P35453 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXD13P35453 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXD13P35453 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXD13P35453 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXD13P35453 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXD13P35453 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXD13P35453 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXD13P35453 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXD13P35453 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXD13P35453 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXD13P35453 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXD13P35453 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXD13P35453 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXD13P35453 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXD13P35453 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXD13P35453 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXD13P35453 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXD13P35453 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXD13P35453 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXD13P35453 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXD13P35453 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXD13P35453 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXD13P35453 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXD13P35453 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXD13P35453 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXD13P35453 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXD13P35453 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXD13P35453 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms