Protein–RNA interactions for Protein: P35249

RFC4, Replication factor C subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC4P35249 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
RFC4P35249 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RFC4P35249 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RFC4P35249 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RFC4P35249 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RFC4P35249 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RFC4P35249 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RFC4P35249 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RFC4P35249 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
RFC4P35249 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RFC4P35249 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RFC4P35249 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RFC4P35249 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RFC4P35249 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RFC4P35249 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RFC4P35249 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RFC4P35249 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RFC4P35249 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
RFC4P35249 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RFC4P35249 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RFC4P35249 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RFC4P35249 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
RFC4P35249 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RFC4P35249 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RFC4P35249 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RFC4P35249 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RFC4P35249 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RFC4P35249 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RFC4P35249 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RFC4P35249 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RFC4P35249 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RFC4P35249 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
RFC4P35249 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RFC4P35249 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RFC4P35249 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RFC4P35249 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RFC4P35249 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RFC4P35249 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RFC4P35249 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RFC4P35249 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RFC4P35249 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RFC4P35249 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RFC4P35249 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RFC4P35249 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RFC4P35249 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RFC4P35249 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RFC4P35249 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RFC4P35249 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RFC4P35249 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RFC4P35249 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RFC4P35249 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RFC4P35249 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RFC4P35249 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RFC4P35249 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RFC4P35249 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RFC4P35249 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RFC4P35249 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RFC4P35249 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RFC4P35249 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RFC4P35249 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RFC4P35249 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RFC4P35249 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
RFC4P35249 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RFC4P35249 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RFC4P35249 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RFC4P35249 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RFC4P35249 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RFC4P35249 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RFC4P35249 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RFC4P35249 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
RFC4P35249 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
RFC4P35249 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
RFC4P35249 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
RFC4P35249 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RFC4P35249 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
RFC4P35249 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RFC4P35249 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RFC4P35249 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RFC4P35249 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RFC4P35249 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RFC4P35249 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RFC4P35249 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RFC4P35249 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RFC4P35249 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
RFC4P35249 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RFC4P35249 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RFC4P35249 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RFC4P35249 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RFC4P35249 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RFC4P35249 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RFC4P35249 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RFC4P35249 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RFC4P35249 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RFC4P35249 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RFC4P35249 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RFC4P35249 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RFC4P35249 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RFC4P35249 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RFC4P35249 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RFC4P35249 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms