Protein–RNA interactions for Protein: P35240

NF2, Merlin, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NF2P35240 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NF2P35240 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NF2P35240 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NF2P35240 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NF2P35240 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NF2P35240 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NF2P35240 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NF2P35240 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NF2P35240 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
NF2P35240 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NF2P35240 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NF2P35240 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NF2P35240 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NF2P35240 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NF2P35240 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NF2P35240 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NF2P35240 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NF2P35240 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NF2P35240 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NF2P35240 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NF2P35240 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NF2P35240 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
NF2P35240 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NF2P35240 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NF2P35240 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
NF2P35240 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NF2P35240 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NF2P35240 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NF2P35240 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NF2P35240 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NF2P35240 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NF2P35240 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
NF2P35240 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NF2P35240 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NF2P35240 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NF2P35240 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NF2P35240 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NF2P35240 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
NF2P35240 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
NF2P35240 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
NF2P35240 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NF2P35240 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NF2P35240 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NF2P35240 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NF2P35240 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NF2P35240 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
NF2P35240 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NF2P35240 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
NF2P35240 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NF2P35240 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NF2P35240 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NF2P35240 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NF2P35240 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NF2P35240 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NF2P35240 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NF2P35240 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NF2P35240 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NF2P35240 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NF2P35240 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NF2P35240 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NF2P35240 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NF2P35240 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NF2P35240 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NF2P35240 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NF2P35240 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NF2P35240 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NF2P35240 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NF2P35240 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NF2P35240 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NF2P35240 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NF2P35240 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NF2P35240 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NF2P35240 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NF2P35240 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NF2P35240 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NF2P35240 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NF2P35240 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NF2P35240 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NF2P35240 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NF2P35240 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NF2P35240 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NF2P35240 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NF2P35240 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NF2P35240 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NF2P35240 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NF2P35240 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NF2P35240 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NF2P35240 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
NF2P35240 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NF2P35240 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NF2P35240 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NF2P35240 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NF2P35240 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
NF2P35240 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NF2P35240 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
NF2P35240 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NF2P35240 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NF2P35240 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NF2P35240 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NF2P35240 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms