Protein–RNA interactions for Protein: P33241

LSP1, Lymphocyte-specific protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSP1P33241 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LSP1P33241 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LSP1P33241 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LSP1P33241 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LSP1P33241 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LSP1P33241 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LSP1P33241 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LSP1P33241 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LSP1P33241 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LSP1P33241 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LSP1P33241 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LSP1P33241 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LSP1P33241 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LSP1P33241 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LSP1P33241 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LSP1P33241 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LSP1P33241 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LSP1P33241 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LSP1P33241 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LSP1P33241 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LSP1P33241 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LSP1P33241 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LSP1P33241 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LSP1P33241 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LSP1P33241 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LSP1P33241 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LSP1P33241 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LSP1P33241 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LSP1P33241 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LSP1P33241 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LSP1P33241 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LSP1P33241 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LSP1P33241 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LSP1P33241 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LSP1P33241 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LSP1P33241 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LSP1P33241 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LSP1P33241 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LSP1P33241 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LSP1P33241 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LSP1P33241 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LSP1P33241 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LSP1P33241 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LSP1P33241 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LSP1P33241 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LSP1P33241 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LSP1P33241 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LSP1P33241 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LSP1P33241 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LSP1P33241 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LSP1P33241 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LSP1P33241 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LSP1P33241 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LSP1P33241 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LSP1P33241 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LSP1P33241 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LSP1P33241 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LSP1P33241 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LSP1P33241 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LSP1P33241 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LSP1P33241 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LSP1P33241 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LSP1P33241 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LSP1P33241 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LSP1P33241 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LSP1P33241 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LSP1P33241 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LSP1P33241 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LSP1P33241 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LSP1P33241 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LSP1P33241 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LSP1P33241 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LSP1P33241 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LSP1P33241 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LSP1P33241 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LSP1P33241 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LSP1P33241 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LSP1P33241 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LSP1P33241 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LSP1P33241 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LSP1P33241 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LSP1P33241 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LSP1P33241 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LSP1P33241 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LSP1P33241 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LSP1P33241 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LSP1P33241 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LSP1P33241 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LSP1P33241 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LSP1P33241 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LSP1P33241 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LSP1P33241 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LSP1P33241 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LSP1P33241 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LSP1P33241 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LSP1P33241 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LSP1P33241 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LSP1P33241 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LSP1P33241 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LSP1P33241 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms