Protein–RNA interactions for Protein: P30281

CCND3, G1/S-specific cyclin-D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND3P30281 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCND3P30281 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCND3P30281 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCND3P30281 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCND3P30281 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCND3P30281 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCND3P30281 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCND3P30281 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCND3P30281 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCND3P30281 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCND3P30281 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCND3P30281 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCND3P30281 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCND3P30281 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCND3P30281 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCND3P30281 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCND3P30281 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCND3P30281 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCND3P30281 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCND3P30281 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCND3P30281 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCND3P30281 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCND3P30281 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCND3P30281 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCND3P30281 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCND3P30281 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCND3P30281 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCND3P30281 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCND3P30281 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCND3P30281 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCND3P30281 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCND3P30281 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CCND3P30281 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCND3P30281 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCND3P30281 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCND3P30281 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCND3P30281 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCND3P30281 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCND3P30281 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCND3P30281 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CCND3P30281 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCND3P30281 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCND3P30281 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCND3P30281 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCND3P30281 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCND3P30281 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCND3P30281 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCND3P30281 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCND3P30281 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCND3P30281 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCND3P30281 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCND3P30281 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCND3P30281 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCND3P30281 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CCND3P30281 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCND3P30281 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCND3P30281 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCND3P30281 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCND3P30281 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCND3P30281 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCND3P30281 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCND3P30281 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCND3P30281 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCND3P30281 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCND3P30281 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCND3P30281 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCND3P30281 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCND3P30281 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CCND3P30281 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CCND3P30281 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCND3P30281 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCND3P30281 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCND3P30281 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCND3P30281 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCND3P30281 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCND3P30281 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCND3P30281 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCND3P30281 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCND3P30281 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCND3P30281 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCND3P30281 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCND3P30281 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCND3P30281 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCND3P30281 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCND3P30281 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCND3P30281 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCND3P30281 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCND3P30281 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCND3P30281 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCND3P30281 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCND3P30281 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCND3P30281 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCND3P30281 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCND3P30281 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCND3P30281 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCND3P30281 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCND3P30281 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCND3P30281 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCND3P30281 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCND3P30281 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms