Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYT1P21579 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYT1P21579 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYT1P21579 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYT1P21579 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYT1P21579 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYT1P21579 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYT1P21579 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYT1P21579 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYT1P21579 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYT1P21579 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYT1P21579 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYT1P21579 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYT1P21579 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYT1P21579 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYT1P21579 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYT1P21579 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SYT1P21579 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYT1P21579 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYT1P21579 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYT1P21579 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SYT1P21579 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SYT1P21579 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYT1P21579 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYT1P21579 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYT1P21579 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYT1P21579 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYT1P21579 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYT1P21579 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYT1P21579 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYT1P21579 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYT1P21579 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYT1P21579 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYT1P21579 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYT1P21579 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYT1P21579 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYT1P21579 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYT1P21579 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYT1P21579 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYT1P21579 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYT1P21579 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYT1P21579 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYT1P21579 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYT1P21579 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYT1P21579 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYT1P21579 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYT1P21579 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYT1P21579 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYT1P21579 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SYT1P21579 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYT1P21579 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYT1P21579 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYT1P21579 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYT1P21579 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYT1P21579 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYT1P21579 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SYT1P21579 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYT1P21579 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYT1P21579 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYT1P21579 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYT1P21579 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYT1P21579 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYT1P21579 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYT1P21579 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYT1P21579 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYT1P21579 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SYT1P21579 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SYT1P21579 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYT1P21579 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYT1P21579 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYT1P21579 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYT1P21579 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYT1P21579 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYT1P21579 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYT1P21579 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYT1P21579 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SYT1P21579 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYT1P21579 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYT1P21579 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SYT1P21579 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYT1P21579 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYT1P21579 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYT1P21579 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYT1P21579 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYT1P21579 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYT1P21579 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYT1P21579 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SYT1P21579 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SYT1P21579 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYT1P21579 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYT1P21579 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYT1P21579 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYT1P21579 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYT1P21579 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYT1P21579 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYT1P21579 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYT1P21579 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYT1P21579 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYT1P21579 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYT1P21579 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms