Protein–RNA interactions for Protein: P19484

TFEB, Transcription factor EB, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFEBP19484 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TFEBP19484 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TFEBP19484 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TFEBP19484 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TFEBP19484 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TFEBP19484 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TFEBP19484 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TFEBP19484 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TFEBP19484 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TFEBP19484 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TFEBP19484 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TFEBP19484 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TFEBP19484 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TFEBP19484 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TFEBP19484 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TFEBP19484 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TFEBP19484 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TFEBP19484 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TFEBP19484 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TFEBP19484 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TFEBP19484 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
TFEBP19484 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TFEBP19484 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TFEBP19484 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TFEBP19484 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TFEBP19484 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TFEBP19484 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TFEBP19484 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TFEBP19484 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TFEBP19484 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TFEBP19484 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TFEBP19484 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TFEBP19484 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TFEBP19484 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TFEBP19484 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TFEBP19484 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TFEBP19484 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TFEBP19484 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TFEBP19484 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TFEBP19484 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TFEBP19484 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TFEBP19484 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TFEBP19484 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TFEBP19484 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TFEBP19484 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TFEBP19484 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TFEBP19484 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TFEBP19484 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TFEBP19484 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TFEBP19484 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TFEBP19484 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TFEBP19484 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TFEBP19484 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TFEBP19484 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TFEBP19484 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TFEBP19484 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TFEBP19484 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TFEBP19484 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TFEBP19484 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TFEBP19484 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TFEBP19484 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TFEBP19484 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TFEBP19484 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TFEBP19484 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TFEBP19484 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TFEBP19484 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TFEBP19484 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TFEBP19484 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TFEBP19484 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TFEBP19484 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TFEBP19484 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TFEBP19484 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TFEBP19484 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TFEBP19484 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TFEBP19484 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TFEBP19484 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TFEBP19484 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TFEBP19484 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TFEBP19484 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TFEBP19484 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TFEBP19484 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TFEBP19484 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TFEBP19484 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TFEBP19484 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TFEBP19484 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TFEBP19484 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
TFEBP19484 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TFEBP19484 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TFEBP19484 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TFEBP19484 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TFEBP19484 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TFEBP19484 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TFEBP19484 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TFEBP19484 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TFEBP19484 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TFEBP19484 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TFEBP19484 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TFEBP19484 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TFEBP19484 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TFEBP19484 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms