Protein–RNA interactions for Protein: P06796

Csn3, Kappa-casein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn3P06796 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csn3P06796 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csn3P06796 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csn3P06796 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csn3P06796 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Csn3P06796 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csn3P06796 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Csn3P06796 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csn3P06796 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csn3P06796 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csn3P06796 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Csn3P06796 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Csn3P06796 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Csn3P06796 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csn3P06796 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csn3P06796 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csn3P06796 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Csn3P06796 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csn3P06796 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Csn3P06796 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csn3P06796 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Csn3P06796 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csn3P06796 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csn3P06796 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csn3P06796 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Csn3P06796 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Csn3P06796 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csn3P06796 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Csn3P06796 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Csn3P06796 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csn3P06796 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csn3P06796 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csn3P06796 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Csn3P06796 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Csn3P06796 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csn3P06796 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Csn3P06796 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Csn3P06796 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Csn3P06796 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Csn3P06796 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Csn3P06796 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Csn3P06796 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Csn3P06796 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csn3P06796 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csn3P06796 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csn3P06796 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csn3P06796 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csn3P06796 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Csn3P06796 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Csn3P06796 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Csn3P06796 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Csn3P06796 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csn3P06796 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csn3P06796 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csn3P06796 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Csn3P06796 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Csn3P06796 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csn3P06796 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csn3P06796 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csn3P06796 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csn3P06796 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Csn3P06796 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Csn3P06796 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Csn3P06796 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Csn3P06796 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csn3P06796 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csn3P06796 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csn3P06796 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Csn3P06796 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Csn3P06796 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csn3P06796 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Csn3P06796 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Csn3P06796 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Csn3P06796 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Csn3P06796 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Csn3P06796 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Csn3P06796 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Csn3P06796 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Csn3P06796 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Csn3P06796 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Csn3P06796 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Csn3P06796 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Csn3P06796 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csn3P06796 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csn3P06796 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csn3P06796 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csn3P06796 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csn3P06796 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Csn3P06796 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Csn3P06796 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csn3P06796 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csn3P06796 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csn3P06796 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csn3P06796 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csn3P06796 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csn3P06796 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csn3P06796 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csn3P06796 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csn3P06796 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csn3P06796 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms