Protein–RNA interactions for Protein: O43526

KCNQ2, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 2, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ2O43526 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
KCNQ2O43526 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
KCNQ2O43526 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
KCNQ2O43526 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
KCNQ2O43526 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
KCNQ2O43526 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
KCNQ2O43526 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
KCNQ2O43526 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
KCNQ2O43526 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
KCNQ2O43526 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
KCNQ2O43526 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
KCNQ2O43526 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
KCNQ2O43526 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
KCNQ2O43526 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
KCNQ2O43526 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
KCNQ2O43526 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
KCNQ2O43526 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
KCNQ2O43526 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
KCNQ2O43526 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
KCNQ2O43526 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
KCNQ2O43526 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
KCNQ2O43526 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
KCNQ2O43526 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
KCNQ2O43526 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
KCNQ2O43526 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
KCNQ2O43526 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
KCNQ2O43526 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
KCNQ2O43526 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
KCNQ2O43526 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
KCNQ2O43526 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
KCNQ2O43526 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
KCNQ2O43526 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
KCNQ2O43526 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
KCNQ2O43526 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
KCNQ2O43526 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
KCNQ2O43526 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
KCNQ2O43526 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
KCNQ2O43526 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
KCNQ2O43526 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
KCNQ2O43526 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
KCNQ2O43526 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
KCNQ2O43526 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
KCNQ2O43526 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
KCNQ2O43526 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
KCNQ2O43526 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
KCNQ2O43526 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
KCNQ2O43526 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
KCNQ2O43526 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
KCNQ2O43526 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
KCNQ2O43526 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
KCNQ2O43526 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
KCNQ2O43526 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
KCNQ2O43526 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
KCNQ2O43526 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
KCNQ2O43526 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
KCNQ2O43526 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
KCNQ2O43526 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
KCNQ2O43526 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
KCNQ2O43526 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
KCNQ2O43526 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
KCNQ2O43526 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
KCNQ2O43526 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
KCNQ2O43526 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
KCNQ2O43526 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
KCNQ2O43526 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
KCNQ2O43526 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
KCNQ2O43526 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
KCNQ2O43526 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
KCNQ2O43526 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
KCNQ2O43526 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
KCNQ2O43526 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
KCNQ2O43526 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
KCNQ2O43526 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
KCNQ2O43526 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC29.48■■■□□ 2.31
KCNQ2O43526 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
KCNQ2O43526 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
KCNQ2O43526 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
KCNQ2O43526 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
KCNQ2O43526 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
KCNQ2O43526 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
KCNQ2O43526 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
KCNQ2O43526 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
KCNQ2O43526 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
KCNQ2O43526 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
KCNQ2O43526 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
KCNQ2O43526 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
KCNQ2O43526 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
KCNQ2O43526 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
KCNQ2O43526 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
KCNQ2O43526 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
KCNQ2O43526 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
KCNQ2O43526 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
KCNQ2O43526 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
KCNQ2O43526 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
KCNQ2O43526 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
KCNQ2O43526 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
KCNQ2O43526 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
KCNQ2O43526 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
KCNQ2O43526 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
KCNQ2O43526 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms