Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
FANCAO15360 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
FANCAO15360 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
FANCAO15360 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
FANCAO15360 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
FANCAO15360 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
FANCAO15360 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
FANCAO15360 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
FANCAO15360 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
FANCAO15360 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
FANCAO15360 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
FANCAO15360 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
FANCAO15360 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
FANCAO15360 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
FANCAO15360 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
FANCAO15360 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
FANCAO15360 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
FANCAO15360 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
FANCAO15360 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
FANCAO15360 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
FANCAO15360 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
FANCAO15360 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
FANCAO15360 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
FANCAO15360 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
FANCAO15360 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
FANCAO15360 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
FANCAO15360 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
FANCAO15360 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
FANCAO15360 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
FANCAO15360 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
FANCAO15360 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
FANCAO15360 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
FANCAO15360 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
FANCAO15360 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
FANCAO15360 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
FANCAO15360 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
FANCAO15360 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC34.69■■■■□ 3.14
FANCAO15360 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
FANCAO15360 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
FANCAO15360 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
FANCAO15360 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC34.68■■■■□ 3.14
FANCAO15360 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
FANCAO15360 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC34.68■■■■□ 3.14
FANCAO15360 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
FANCAO15360 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
FANCAO15360 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
FANCAO15360 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
FANCAO15360 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
FANCAO15360 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
FANCAO15360 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
FANCAO15360 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
FANCAO15360 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
FANCAO15360 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
FANCAO15360 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
FANCAO15360 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
FANCAO15360 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
FANCAO15360 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
FANCAO15360 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
FANCAO15360 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
FANCAO15360 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC34.65■■■■□ 3.14
FANCAO15360 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
FANCAO15360 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
FANCAO15360 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
FANCAO15360 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
FANCAO15360 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
FANCAO15360 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
FANCAO15360 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
FANCAO15360 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
FANCAO15360 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC34.64■■■■□ 3.14
FANCAO15360 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
FANCAO15360 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
FANCAO15360 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
FANCAO15360 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
FANCAO15360 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
FANCAO15360 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
FANCAO15360 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
FANCAO15360 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
FANCAO15360 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC34.63■■■■□ 3.13
FANCAO15360 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
FANCAO15360 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
FANCAO15360 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
FANCAO15360 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
FANCAO15360 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
FANCAO15360 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
FANCAO15360 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
FANCAO15360 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
FANCAO15360 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
FANCAO15360 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
FANCAO15360 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
FANCAO15360 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
FANCAO15360 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
FANCAO15360 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
FANCAO15360 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
FANCAO15360 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
FANCAO15360 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
FANCAO15360 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
FANCAO15360 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
FANCAO15360 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
FANCAO15360 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
FANCAO15360 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms