Protein–RNA interactions for Protein: O15228

GNPAT, Dihydroxyacetone phosphate acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 680 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPATO15228 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GNPATO15228 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GNPATO15228 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GNPATO15228 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GNPATO15228 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GNPATO15228 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GNPATO15228 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GNPATO15228 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GNPATO15228 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GNPATO15228 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GNPATO15228 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GNPATO15228 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
GNPATO15228 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
GNPATO15228 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
GNPATO15228 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GNPATO15228 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GNPATO15228 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
GNPATO15228 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GNPATO15228 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
GNPATO15228 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GNPATO15228 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
GNPATO15228 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GNPATO15228 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
GNPATO15228 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
GNPATO15228 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GNPATO15228 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GNPATO15228 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GNPATO15228 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GNPATO15228 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GNPATO15228 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GNPATO15228 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GNPATO15228 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GNPATO15228 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GNPATO15228 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GNPATO15228 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GNPATO15228 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GNPATO15228 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GNPATO15228 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GNPATO15228 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GNPATO15228 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GNPATO15228 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GNPATO15228 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
GNPATO15228 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GNPATO15228 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GNPATO15228 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
GNPATO15228 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
GNPATO15228 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
GNPATO15228 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
GNPATO15228 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
GNPATO15228 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
GNPATO15228 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GNPATO15228 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GNPATO15228 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GNPATO15228 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
GNPATO15228 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GNPATO15228 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GNPATO15228 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GNPATO15228 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GNPATO15228 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GNPATO15228 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GNPATO15228 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GNPATO15228 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GNPATO15228 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GNPATO15228 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GNPATO15228 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GNPATO15228 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GNPATO15228 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GNPATO15228 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GNPATO15228 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GNPATO15228 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GNPATO15228 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GNPATO15228 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GNPATO15228 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GNPATO15228 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GNPATO15228 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
GNPATO15228 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GNPATO15228 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GNPATO15228 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GNPATO15228 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GNPATO15228 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GNPATO15228 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
GNPATO15228 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GNPATO15228 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GNPATO15228 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GNPATO15228 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GNPATO15228 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GNPATO15228 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GNPATO15228 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
GNPATO15228 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
GNPATO15228 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GNPATO15228 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
GNPATO15228 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
GNPATO15228 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GNPATO15228 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
GNPATO15228 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
GNPATO15228 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GNPATO15228 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
GNPATO15228 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GNPATO15228 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
GNPATO15228 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms