Protein–RNA interactions for Protein: J3QR89

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QR89 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
J3QR89 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
J3QR89 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
J3QR89 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
J3QR89 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
J3QR89 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
J3QR89 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
J3QR89 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
J3QR89 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
J3QR89 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3QR89 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3QR89 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3QR89 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3QR89 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3QR89 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3QR89 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3QR89 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3QR89 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3QR89 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3QR89 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3QR89 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3QR89 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3QR89 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3QR89 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3QR89 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3QR89 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3QR89 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3QR89 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3QR89 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
J3QR89 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3QR89 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3QR89 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
J3QR89 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
J3QR89 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
J3QR89 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
J3QR89 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
J3QR89 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
J3QR89 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
J3QR89 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
J3QR89 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
J3QR89 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
J3QR89 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
J3QR89 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
J3QR89 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
J3QR89 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
J3QR89 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
J3QR89 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
J3QR89 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
J3QR89 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
J3QR89 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
J3QR89 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3QR89 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3QR89 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3QR89 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3QR89 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3QR89 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3QR89 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3QR89 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3QR89 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3QR89 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3QR89 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3QR89 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3QR89 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3QR89 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3QR89 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3QR89 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3QR89 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3QR89 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3QR89 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3QR89 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3QR89 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3QR89 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
J3QR89 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
J3QR89 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
J3QR89 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
J3QR89 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
J3QR89 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
J3QR89 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
J3QR89 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
J3QR89 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
J3QR89 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
J3QR89 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
J3QR89 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
J3QR89 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
J3QR89 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
J3QR89 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
J3QR89 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
J3QR89 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
J3QR89 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
J3QR89 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
J3QR89 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
J3QR89 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
J3QR89 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
J3QR89 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
J3QR89 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
J3QR89 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
J3QR89 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
J3QR89 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
J3QR89 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
J3QR89 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms