Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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GTF3C6Q969F1 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
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GTF3C6Q969F1 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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GTF3C6Q969F1 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
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GTF3C6Q969F1 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
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GTF3C6Q969F1 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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GTF3C6Q969F1 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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GTF3C6Q969F1 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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GTF3C6Q969F1 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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GTF3C6Q969F1 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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GTF3C6Q969F1 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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GTF3C6Q969F1 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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