Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.2 ms