Protein–RNA interactions for Protein: P15056

BRAF, Serine/threonine-protein kinase B-raf, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAFP15056 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
BRAFP15056 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BRAFP15056 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
BRAFP15056 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
BRAFP15056 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
BRAFP15056 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BRAFP15056 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BRAFP15056 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
BRAFP15056 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
BRAFP15056 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BRAFP15056 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BRAFP15056 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BRAFP15056 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BRAFP15056 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BRAFP15056 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BRAFP15056 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BRAFP15056 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BRAFP15056 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BRAFP15056 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BRAFP15056 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BRAFP15056 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BRAFP15056 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BRAFP15056 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BRAFP15056 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BRAFP15056 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BRAFP15056 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BRAFP15056 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BRAFP15056 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BRAFP15056 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BRAFP15056 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BRAFP15056 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BRAFP15056 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BRAFP15056 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BRAFP15056 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BRAFP15056 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BRAFP15056 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BRAFP15056 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BRAFP15056 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BRAFP15056 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BRAFP15056 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BRAFP15056 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BRAFP15056 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BRAFP15056 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BRAFP15056 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BRAFP15056 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BRAFP15056 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
BRAFP15056 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BRAFP15056 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BRAFP15056 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BRAFP15056 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BRAFP15056 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BRAFP15056 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BRAFP15056 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BRAFP15056 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BRAFP15056 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BRAFP15056 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BRAFP15056 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BRAFP15056 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BRAFP15056 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
BRAFP15056 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BRAFP15056 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BRAFP15056 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BRAFP15056 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
BRAFP15056 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BRAFP15056 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BRAFP15056 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BRAFP15056 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BRAFP15056 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
BRAFP15056 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BRAFP15056 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BRAFP15056 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BRAFP15056 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BRAFP15056 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BRAFP15056 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
BRAFP15056 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
BRAFP15056 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
BRAFP15056 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
BRAFP15056 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
BRAFP15056 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
BRAFP15056 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
BRAFP15056 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BRAFP15056 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
BRAFP15056 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BRAFP15056 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
BRAFP15056 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BRAFP15056 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
BRAFP15056 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
BRAFP15056 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
BRAFP15056 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
BRAFP15056 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
BRAFP15056 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BRAFP15056 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
BRAFP15056 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
BRAFP15056 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
BRAFP15056 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
BRAFP15056 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BRAFP15056 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
BRAFP15056 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
BRAFP15056 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
BRAFP15056 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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