Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 KIAA0513-201ENST00000258180 7404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 PIK3CG-205ENST00000496166 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 CCDC92-208ENST00000545135 4883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC9.29□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 TXN2-201ENST00000216185 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC9.29□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC9.29□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC9.29□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC9.29□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC9.29□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 STOX2-201ENST00000308497 10458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 ENO2-214ENST00000545045 1911 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms