Protein–RNA interactions for Protein: P78348

ASIC1, Acid-sensing ion channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC1P78348 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms