Protein–RNA interactions for Protein: Q01546

KRT76, Keratin, type II cytoskeletal 2 oral, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT76Q01546 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT76Q01546 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT76Q01546 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT76Q01546 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT76Q01546 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT76Q01546 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT76Q01546 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT76Q01546 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT76Q01546 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT76Q01546 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT76Q01546 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT76Q01546 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT76Q01546 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRT76Q01546 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT76Q01546 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT76Q01546 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT76Q01546 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT76Q01546 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT76Q01546 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT76Q01546 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT76Q01546 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT76Q01546 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT76Q01546 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT76Q01546 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT76Q01546 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT76Q01546 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT76Q01546 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT76Q01546 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT76Q01546 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT76Q01546 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT76Q01546 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT76Q01546 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT76Q01546 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT76Q01546 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT76Q01546 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT76Q01546 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT76Q01546 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT76Q01546 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT76Q01546 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT76Q01546 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT76Q01546 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT76Q01546 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT76Q01546 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT76Q01546 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT76Q01546 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT76Q01546 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT76Q01546 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT76Q01546 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT76Q01546 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT76Q01546 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT76Q01546 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT76Q01546 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT76Q01546 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT76Q01546 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT76Q01546 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT76Q01546 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT76Q01546 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT76Q01546 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT76Q01546 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT76Q01546 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT76Q01546 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT76Q01546 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT76Q01546 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT76Q01546 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT76Q01546 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT76Q01546 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT76Q01546 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT76Q01546 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT76Q01546 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT76Q01546 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT76Q01546 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT76Q01546 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT76Q01546 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT76Q01546 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT76Q01546 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT76Q01546 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT76Q01546 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT76Q01546 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT76Q01546 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT76Q01546 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT76Q01546 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT76Q01546 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT76Q01546 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT76Q01546 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT76Q01546 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT76Q01546 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT76Q01546 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT76Q01546 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT76Q01546 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT76Q01546 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT76Q01546 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT76Q01546 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT76Q01546 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT76Q01546 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT76Q01546 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT76Q01546 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
KRT76Q01546 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.14
KRT76Q01546 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
KRT76Q01546 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
KRT76Q01546 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms