Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 PTGER4P2-201ENST00000328411 252 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 MORN2-201ENST00000340556 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 SIX3-AS1-201ENST00000419364 844 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 AL035413.1-201ENST00000437898 507 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 NALT1-202ENST00000450304 437 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 PTGER4P3-201ENST00000458150 252 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 LRRC75A-AS1-214ENST00000487066 763 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 AC107464.2-201ENST00000502923 569 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 APOC1-209ENST00000592885 562 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 AC005274.1-201ENST00000623460 802 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 AC092115.1-201ENST00000566277 1402 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 CFAP36-204ENST00000406691 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 HMOX2-201ENST00000219700 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 RIDA-201ENST00000254878 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 HIST1H2BK-201ENST00000356950 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 S100A13-203ENST00000392623 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 AL161733.1-201ENST00000421067 462 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 ZMIZ1-AS1-202ENST00000440151 814 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 FOXP4-AS1-205ENST00000454812 575 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 CU639417.1-201ENST00000464664 460 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 AC092903.1-201ENST00000466506 262 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 UBR5-AS1-202ENST00000520820 800 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 H2BFS-201ENST00000599962 460 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 RNF103-CHMP3-202ENST00000604011 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 FCRL1-207ENST00000491942 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 AC022080.1-201ENST00000366255 781 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 PIFO-201ENST00000369737 746 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 IFNLR1-203ENST00000374418 674 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 AL080243.1-201ENST00000423293 1060 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 AL929302.1-201ENST00000426556 871 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 RN7SL147P-201ENST00000487345 298 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 ZNF576-205ENST00000529930 830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 LINC02252-201ENST00000565706 487 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 KXD1-211ENST00000599319 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 RPL18A-203ENST00000599870 1084 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 AC008982.2-201ENST00000600473 493 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 Metazoa_SRP.200-201ENST00000622073 282 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 AC126755.5-201ENST00000622756 267 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 ESR1-214ENST00000638569 132 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms