Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHST12Q9NRB3 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CHST12Q9NRB3 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHST12Q9NRB3 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHST12Q9NRB3 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHST12Q9NRB3 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHST12Q9NRB3 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHST12Q9NRB3 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHST12Q9NRB3 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHST12Q9NRB3 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHST12Q9NRB3 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHST12Q9NRB3 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHST12Q9NRB3 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHST12Q9NRB3 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHST12Q9NRB3 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHST12Q9NRB3 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHST12Q9NRB3 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHST12Q9NRB3 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHST12Q9NRB3 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHST12Q9NRB3 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHST12Q9NRB3 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CHST12Q9NRB3 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHST12Q9NRB3 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHST12Q9NRB3 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHST12Q9NRB3 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms