Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C2

TCAF1, TRPM8 channel-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 921 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCAF1Q9Y4C2 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
TCAF1Q9Y4C2 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms