Protein–RNA interactions for Protein: Q14247

CTTN, Src substrate cortactin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNQ14247 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTTNQ14247 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTTNQ14247 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTTNQ14247 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CTTNQ14247 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTTNQ14247 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CTTNQ14247 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTTNQ14247 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTTNQ14247 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTTNQ14247 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTTNQ14247 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTTNQ14247 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CTTNQ14247 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTTNQ14247 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTTNQ14247 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTTNQ14247 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTTNQ14247 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTTNQ14247 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTTNQ14247 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTTNQ14247 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTTNQ14247 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTTNQ14247 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTTNQ14247 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTTNQ14247 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTTNQ14247 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTTNQ14247 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTTNQ14247 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTTNQ14247 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTTNQ14247 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTTNQ14247 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTTNQ14247 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTTNQ14247 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CTTNQ14247 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CTTNQ14247 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTTNQ14247 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTTNQ14247 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CTTNQ14247 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTTNQ14247 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTTNQ14247 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CTTNQ14247 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CTTNQ14247 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CTTNQ14247 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CTTNQ14247 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTTNQ14247 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTTNQ14247 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTTNQ14247 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTTNQ14247 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTTNQ14247 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTTNQ14247 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTTNQ14247 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTTNQ14247 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTTNQ14247 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTTNQ14247 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTTNQ14247 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CTTNQ14247 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTTNQ14247 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTTNQ14247 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTTNQ14247 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTTNQ14247 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTTNQ14247 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTTNQ14247 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTTNQ14247 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTTNQ14247 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTTNQ14247 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTTNQ14247 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTTNQ14247 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTTNQ14247 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms