Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 PPME1-201ENST00000328257 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 AP001972.5-201ENST00000624624 2338 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 217.5 ms