Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCSER1Q9C0I3 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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