Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms