Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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