Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 CTSL-202ENST00000342020 933 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 SNX15-201ENST00000352068 771 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 RPS14P4-201ENST00000415880 418 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 AC004895.1-203ENST00000428901 540 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 CASP3-205ENST00000517513 964 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 AC090572.2-201ENST00000520649 761 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 RBM4-211ENST00000530235 1011 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 AC007386.2-202ENST00000622718 1018 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 LAMP5-202ENST00000427562 1309 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 SUMO4-201ENST00000326669 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 PTGER4P2-201ENST00000328411 252 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 PTGER4P3-201ENST00000458150 252 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 AC079949.1-201ENST00000541419 505 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 AC090001.1-201ENST00000553194 467 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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