Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 NAAA-203ENST00000505594 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GAPVD1Q14C86 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GAPVD1Q14C86 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GAPVD1Q14C86 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GAPVD1Q14C86 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GAPVD1Q14C86 S100A2-202ENST00000368708 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GAPVD1Q14C86 CDRT15L2-201ENST00000399044 1048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GAPVD1Q14C86 Z82185.1-201ENST00000417792 549 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GAPVD1Q14C86 AL109924.1-201ENST00000444586 914 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GAPVD1Q14C86 AL021391.1-201ENST00000454439 545 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GAPVD1Q14C86 AC007679.1-201ENST00000458609 502 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GAPVD1Q14C86 AC023051.2-201ENST00000541141 460 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GAPVD1Q14C86 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GAPVD1Q14C86 AL080250.1-203ENST00000607799 747 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GAPVD1Q14C86 Metazoa_SRP.153-201ENST00000620153 341 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GAPVD1Q14C86 ERAS-202ENST00000636362 826 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GAPVD1Q14C86 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GAPVD1Q14C86 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GAPVD1Q14C86 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GAPVD1Q14C86 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GAPVD1Q14C86 KRT8P38-201ENST00000441370 1430 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GAPVD1Q14C86 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GAPVD1Q14C86 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GAPVD1Q14C86 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GAPVD1Q14C86 EDN1-201ENST00000379375 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GAPVD1Q14C86 HSD3BP1-201ENST00000286193 1111 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GAPVD1Q14C86 TAC4-203ENST00000352793 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GAPVD1Q14C86 DPPA5-201ENST00000370370 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GAPVD1Q14C86 DNM1P46-202ENST00000415963 882 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GAPVD1Q14C86 DLGAP4-AS1-203ENST00000439595 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GAPVD1Q14C86 AL121656.1-201ENST00000440786 482 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GAPVD1Q14C86 AC122694.1-201ENST00000510987 563 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GAPVD1Q14C86 AL513165.2-203ENST00000537239 717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GAPVD1Q14C86 IFI27L1-211ENST00000557066 580 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GAPVD1Q14C86 AC009065.4-201ENST00000563734 543 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GAPVD1Q14C86 AC090617.4-201ENST00000572404 422 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GAPVD1Q14C86 LINC00514-203ENST00000573465 313 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GAPVD1Q14C86 LINC02081-201ENST00000586185 877 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GAPVD1Q14C86 IFNL3P1-201ENST00000595082 501 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GAPVD1Q14C86 CRABP2-204ENST00000621784 1033 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GAPVD1Q14C86 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GAPVD1Q14C86 AL121753.2-201ENST00000624581 1461 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GAPVD1Q14C86 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GAPVD1Q14C86 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GAPVD1Q14C86 DLG2-205ENST00000398301 2070 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GAPVD1Q14C86 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GAPVD1Q14C86 TUBA1B-202ENST00000336023 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GAPVD1Q14C86 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GAPVD1Q14C86 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GAPVD1Q14C86 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GAPVD1Q14C86 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GAPVD1Q14C86 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GAPVD1Q14C86 SAP18-201ENST00000382533 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GAPVD1Q14C86 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GAPVD1Q14C86 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GAPVD1Q14C86 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GAPVD1Q14C86 WFDC2-203ENST00000342873 818 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GAPVD1Q14C86 NR1I3-201ENST00000367979 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GAPVD1Q14C86 NR1I3-207ENST00000367985 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GAPVD1Q14C86 SH3BGR-202ENST00000380631 780 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GAPVD1Q14C86 BX088651.3-201ENST00000418155 352 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GAPVD1Q14C86 AC093495.1-201ENST00000420253 1067 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GAPVD1Q14C86 NR1I3-225ENST00000508387 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GAPVD1Q14C86 AC007610.1-201ENST00000568130 498 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GAPVD1Q14C86 CLPP-205ENST00000596605 646 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GAPVD1Q14C86 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GAPVD1Q14C86 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GAPVD1Q14C86 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GAPVD1Q14C86 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GAPVD1Q14C86 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GAPVD1Q14C86 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GAPVD1Q14C86 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GAPVD1Q14C86 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GAPVD1Q14C86 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GAPVD1Q14C86 PTN-202ENST00000393083 1599 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GAPVD1Q14C86 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GAPVD1Q14C86 MPZL3-204ENST00000527472 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GAPVD1Q14C86 KRTAP1-5-201ENST00000361883 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GAPVD1Q14C86 MIR339-201ENST00000362153 94 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GAPVD1Q14C86 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GAPVD1Q14C86 TPT1P9-201ENST00000413759 514 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GAPVD1Q14C86 RPL15-205ENST00000415719 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GAPVD1Q14C86 AL512288.1-201ENST00000448015 491 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GAPVD1Q14C86 AC008440.1-201ENST00000455835 439 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GAPVD1Q14C86 AC090907.2-201ENST00000559857 720 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GAPVD1Q14C86 AL031710.1-201ENST00000570022 468 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GAPVD1Q14C86 AC092327.2-201ENST00000595705 901 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GAPVD1Q14C86 GSTT2-203ENST00000634759 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GAPVD1Q14C86 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GAPVD1Q14C86 CA2-201ENST00000285379 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GAPVD1Q14C86 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GAPVD1Q14C86 TMEM182-201ENST00000409173 3198 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GAPVD1Q14C86 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GAPVD1Q14C86 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GAPVD1Q14C86 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GAPVD1Q14C86 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GAPVD1Q14C86 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GAPVD1Q14C86 LINC02347-203ENST00000540774 1442 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GAPVD1Q14C86 RNF121-211ENST00000530137 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GAPVD1Q14C86 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
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