Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 TMEM100-201ENST00000424486 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.1 ms